63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1347 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1347  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  658    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337035  normal  0.221181 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1673  DMT family permease  80.18 
 
 
331 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0223654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  81.76 
 
 
331 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0969353  hitchhiker  0.0000570043 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5337  hypothetical protein  66.87 
 
 
313 aa  434  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2060  hypothetical protein  67.08 
 
 
313 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1929  hypothetical protein  67.09 
 
 
313 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2027  hypothetical protein  65.95 
 
 
338 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0596377  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2047  hypothetical protein  67.52 
 
 
313 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6050  hypothetical protein  65.95 
 
 
338 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1249  hypothetical protein  64.86 
 
 
313 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2503  integral membrane protein  67.19 
 
 
315 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34695  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2593  hypothetical protein  67.82 
 
 
825 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872158  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2447  integral membrane protein  67.51 
 
 
315 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3245  hypothetical protein  67.19 
 
 
315 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.458807  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1338  hypothetical protein  67.19 
 
 
315 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1564  hypothetical protein  67.19 
 
 
315 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0714867  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2018  hypothetical protein  67.82 
 
 
329 aa  378  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2066  hypothetical protein  66.88 
 
 
315 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.954235  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.76 
 
 
306 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.748197  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1890  hypothetical protein  48.78 
 
 
341 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702262  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.06 
 
 
306 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1395  hypothetical protein  50.18 
 
 
306 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1849  hypothetical protein  41.1 
 
 
301 aa  186  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000666124  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1222  integral membrane protein, DUF6  37.92 
 
 
328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.82 
 
 
296 aa  136  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3564  putative transmembrane protein  38.29 
 
 
304 aa  134  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0922  hypothetical protein  34.98 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0191  hypothetical protein  37.32 
 
 
309 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0309  hypothetical protein  34.68 
 
 
299 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0192  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.82 
 
 
313 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0174  hypothetical protein  31.25 
 
 
313 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542868  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1824  hypothetical protein  31.69 
 
 
249 aa  102  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1499  protein of unknown function DUF6  31.69 
 
 
249 aa  102  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0456527  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0486  hypothetical protein  38.37 
 
 
312 aa  96.7  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1538  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.41 
 
 
311 aa  96.3  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0129  hypothetical protein  33.21 
 
 
302 aa  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0251  hypothetical protein  36.04 
 
 
264 aa  88.2  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1889  putative transmembrane protein  26.8 
 
 
288 aa  86.7  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1801  hypothetical protein  29.11 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  30.31 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  33.06 
 
 
353 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  30.31 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  32.65 
 
 
356 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  32.65 
 
 
356 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  32.65 
 
 
356 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  32.65 
 
 
356 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  32.44 
 
 
402 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  31.44 
 
 
308 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  27.62 
 
 
299 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.27 
 
 
282 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.27 
 
 
282 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  33.59 
 
 
281 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  31.16 
 
 
397 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  37.04 
 
 
327 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02390  predicted permease, DMT superfamily  34.48 
 
 
294 aa  45.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.857756  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  31.84 
 
 
309 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  39.39 
 
 
298 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  25.23 
 
 
316 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  21.56 
 
 
297 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  32.99 
 
 
298 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.87 
 
 
318 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  40.82 
 
 
298 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  33.33 
 
 
301 aa  42.7  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>