88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1222 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1222  integral membrane protein, DUF6  100 
 
 		 328 aa  640    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1849  hypothetical protein  50.7 
 
 		 301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000666124  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2047  hypothetical protein  39.07 
 
 		 313 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2060  hypothetical protein  38.74 
 
 		 313 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2027  hypothetical protein  38.74 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0596377  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1929  hypothetical protein  38.41 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6050  hypothetical protein  38.74 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5337  hypothetical protein  38.41 
 
 		 313 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1347  hypothetical protein  37.92 
 
 		 333 aa  185  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337035  normal  0.221181 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1249  hypothetical protein  38.74 
 
 		 313 aa  178  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1673  DMT family permease  41 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0223654 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2503  integral membrane protein  39.86 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34695  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.23 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0969353  hitchhiker  0.0000570043 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2018  hypothetical protein  40.07 
 
 		 329 aa  169  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2447  integral membrane protein  39.86 
 
 		 315 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279852  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2593  hypothetical protein  39.73 
 
 		 825 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872158  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1338  hypothetical protein  39.19 
 
 		 315 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3245  hypothetical protein  39.19 
 
 		 315 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.458807  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1564  hypothetical protein  39.19 
 
 		 315 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0714867  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2066  hypothetical protein  39.19 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.954235  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1890  hypothetical protein  38.89 
 
 		 341 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702262  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 		 306 aa  146  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.748197  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1395  hypothetical protein  38.6 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.65 
 
 		 306 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.67 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3564  putative transmembrane protein  38.02 
 
 		 304 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0922  hypothetical protein  34.41 
 
 		 309 aa  112  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0309  hypothetical protein  35.56 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1499  protein of unknown function DUF6  37.99 
 
 		 249 aa  109  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0456527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1824  hypothetical protein  37.99 
 
 		 249 aa  109  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1538  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.32 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1801  hypothetical protein  26.99 
 
 		 284 aa  93.6  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0192  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.04 
 
 		 313 aa  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0174  hypothetical protein  32.04 
 
 		 313 aa  90.5  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1889  putative transmembrane protein  28.08 
 
 		 288 aa  87  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0251  hypothetical protein  34.67 
 
 		 264 aa  85.9  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0191  hypothetical protein  31.93 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0486  hypothetical protein  32.57 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0129  hypothetical protein  34.39 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.42 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  27.35 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2308  hypothetical protein  27.11 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  26.29 
 
 		 298 aa  52.8  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  25.17 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  25 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  26.32 
 
 		 298 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  28.5 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2440  RarD protein, DMT superfamily transporter  36.17 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.659696  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2719  transporter DMT superfamily protein  29.27 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2776  transporter DMT superfamily protein  29.27 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  25.71 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0806  transporter DMT superfamily protein  30.77 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.86594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  52.94 
 
 		 288 aa  47  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  26.67 
 
 		 296 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  26.67 
 
 		 296 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  26.67 
 
 		 296 aa  47  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  34.11 
 
 		 295 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  31.58 
 
 		 304 aa  46.2  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  26.8 
 
 		 296 aa  46.6  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3092  transporter DMT superfamily protein  23.75 
 
 		 310 aa  45.8  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652908  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  27.31 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  30.95 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  26.56 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06320  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257668  normal  0.652211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  27.45 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0588  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0009394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  30.94 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0508  permease  33.77 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.057497  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0829  RarD protein, DMT superfamily transporter  29.91 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.412123  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  24.84 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  31.37 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  25.27 
 
 		 317 aa  43.5  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0940  transporter DMT superfamily protein  40.62 
 
 		 301 aa  43.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  31.36 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  34.41 
 
 		 294 aa  43.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  28.49 
 
 		 290 aa  43.1  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  28.21 
 
 		 295 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0483  rarD protein  32.77 
 
 		 295 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000325655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  29.7 
 
 		 303 aa  42.7  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  29.49 
 
 		 301 aa  42.7  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  24.43 
 
 		 293 aa  42.7  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.79 
 
 		 289 aa  42.7  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0936  rarD protein  30.94 
 
 		 295 aa  42.4  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  29.08 
 
 		 294 aa  42.4  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  27.56 
 
 		 302 aa  42.4  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0080  RarD protein, DMT superfamily transporter  29.41 
 
 		 292 aa  42.4  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  28.66 
 
 		 295 aa  42.4  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>