259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0829 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0829  RarD protein, DMT superfamily transporter  100 
 
 
307 aa  610  9.999999999999999e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.412123  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1859  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.4 
 
 
310 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.898363  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0599  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.27 
 
 
302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  39.24 
 
 
315 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2317  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.45 
 
 
305 aa  216  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000109763  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  41.79 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  42.35 
 
 
302 aa  212  7e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  41.44 
 
 
305 aa  211  9e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.44 
 
 
309 aa  211  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  37.93 
 
 
295 aa  208  9e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  36.84 
 
 
313 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  40.71 
 
 
294 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  41.11 
 
 
335 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  36.84 
 
 
313 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  36.51 
 
 
313 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3201  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.06 
 
 
333 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.510387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3092  transporter DMT superfamily protein  39.14 
 
 
310 aa  206  5e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652908  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  37.13 
 
 
309 aa  206  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  37.93 
 
 
305 aa  205  8e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  37.13 
 
 
309 aa  205  9e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  36.51 
 
 
313 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  36.51 
 
 
313 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  36.51 
 
 
313 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  36.51 
 
 
313 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  36.51 
 
 
313 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  36.51 
 
 
313 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0806  transporter DMT superfamily protein  41.52 
 
 
300 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.86594  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  37.71 
 
 
313 aa  202  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  37.16 
 
 
301 aa  201  9e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2719  transporter DMT superfamily protein  36.03 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2776  transporter DMT superfamily protein  36.03 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  37.97 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1661  transporter DMT superfamily protein  38.93 
 
 
297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0535  transporter DMT superfamily protein  39.19 
 
 
493 aa  200  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.595832  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3395  RarD protein  41.81 
 
 
301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96482  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  39.21 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  37.46 
 
 
295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  36.95 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  37.5 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4403  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.65 
 
 
304 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  36.77 
 
 
298 aa  196  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  37.85 
 
 
294 aa  197  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  37.15 
 
 
294 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  37.15 
 
 
294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  37.15 
 
 
294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  37.15 
 
 
294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0297  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.06 
 
 
301 aa  196  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  37.15 
 
 
294 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1118  rarD protein  36.64 
 
 
295 aa  195  7e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23910  rarD protein  39.8 
 
 
307 aa  195  9e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00670263  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5070  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.46 
 
 
351 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  34.71 
 
 
296 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2792  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.13 
 
 
344 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  35.96 
 
 
295 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0621  transporter DMT superfamily protein  37.23 
 
 
318 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000105334  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.02 
 
 
307 aa  192  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0477  RarD protein, DMT superfamily transporter  40 
 
 
298 aa  192  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0490  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.54 
 
 
298 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.156296  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  36.08 
 
 
300 aa  191  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.54 
 
 
307 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0936  rarD protein  40.14 
 
 
295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0807  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.97 
 
 
301 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00187361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2425  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.04 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0811  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.97 
 
 
301 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0657773  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0332  rarD protein  36.97 
 
 
293 aa  189  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100395  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0190  transporter DMT superfamily protein  38.28 
 
 
295 aa  188  9e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.7183 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  37.24 
 
 
296 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  35.99 
 
 
301 aa  188  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  37.24 
 
 
296 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  37.24 
 
 
296 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  36.08 
 
 
298 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0760  hypothetical protein  41.24 
 
 
301 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6667  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.94 
 
 
313 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605512  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  36.52 
 
 
298 aa  186  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  35.86 
 
 
296 aa  185  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  35.86 
 
 
296 aa  185  7e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  35.86 
 
 
296 aa  185  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  35.86 
 
 
296 aa  185  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4018  rarD protein  40.89 
 
 
316 aa  185  7e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  34.44 
 
 
302 aa  185  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  35.86 
 
 
296 aa  185  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  35.86 
 
 
296 aa  185  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  35.74 
 
 
295 aa  185  7e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2967  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.8 
 
 
304 aa  185  8e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.895178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0570  hypothetical protein  41.81 
 
 
298 aa  185  9e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2679  RarD protein  39.87 
 
 
312 aa  185  9e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2440  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.55 
 
 
311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.659696  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  35.64 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  35.4 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17690  rarD protein  41.55 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  35.64 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  35.64 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2699  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.21 
 
 
302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  35.42 
 
 
294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3638  transporter DMT superfamily protein  42.09 
 
 
296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0239  RarD protein, DMT superfamily transporter  36.63 
 
 
306 aa  182  9.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.14 
 
 
302 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0080  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.43 
 
 
292 aa  181  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  34.32 
 
 
306 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3414  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.37 
 
 
312 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>