244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23910 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_23910  rarD protein  100 
 
 		 307 aa  615  1e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00670263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.62 
 
 		 309 aa  231  8.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  41.81 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  41.47 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  40.26 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  41.14 
 
 		 313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  41.67 
 
 		 313 aa  219  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  40.8 
 
 		 313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  40.8 
 
 		 313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  40.8 
 
 		 313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  40.8 
 
 		 313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  40.8 
 
 		 313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0599  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.72 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  39.14 
 
 		 315 aa  216  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.95 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0249  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.04 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  40.61 
 
 		 303 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  39.52 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4403  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.16 
 
 		 304 aa  209  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1859  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.61 
 
 		 310 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.898363  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  40.6 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  39.38 
 
 		 294 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  38.49 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3395  RarD protein  39.51 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96482  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0477  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.14 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0806  transporter DMT superfamily protein  41.02 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.86594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2317  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.78 
 
 		 305 aa  203  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000109763  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2425  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.31 
 
 		 309 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  40.2 
 
 		 295 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0332  rarD protein  38.72 
 
 		 293 aa  202  8e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  40.2 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  35.67 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0588  hypothetical protein  40 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0009394  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.86 
 
 		 295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0490  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.12 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.156296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  36.95 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  40.13 
 
 		 295 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3201  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.07 
 
 		 333 aa  198  9e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.510387 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4844  transporter DMT superfamily protein  40.88 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000446481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06320  hypothetical protein  39.66 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257668  normal  0.652211 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0080  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.29 
 
 		 292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2776  transporter DMT superfamily protein  36.24 
 
 		 302 aa  195  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2719  transporter DMT superfamily protein  36.24 
 
 		 302 aa  195  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  37.54 
 
 		 295 aa  195  9e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6667  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.27 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605512  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02860  RarD protein  42.09 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  33.88 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2949  transporter DMT superfamily protein  41.98 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  33.66 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2967  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.49 
 
 		 304 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.895178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2440  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.35 
 
 		 311 aa  192  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.659696  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1661  transporter DMT superfamily protein  37.24 
 
 		 297 aa  192  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  35.45 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  35.45 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0570  hypothetical protein  41.98 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1110  transporter DMT superfamily protein  39.56 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  37.71 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  33.99 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  35.23 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  35.25 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4018  rarD protein  40.14 
 
 		 316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1207  rarD protein  37.25 
 
 		 319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  34.44 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  34.9 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  36.03 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  35.14 
 
 		 294 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  36.75 
 
 		 298 aa  188  8e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3414  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.52 
 
 		 312 aa  188  8e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0621  transporter DMT superfamily protein  35.42 
 
 		 318 aa  188  8e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000105334  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.72 
 
 		 307 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0760  hypothetical protein  41.41 
 
 		 301 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.02 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3544  RarD protein  38.36 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  35.03 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  35.03 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  34.8 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0483  rarD protein  40.6 
 
 		 295 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000325655  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0811  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.41 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0657773  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0807  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.41 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00187361  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  35.97 
 
 		 306 aa  186  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4698  RarD protein  39.93 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000777154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1183  DMT superfamily efflux pump, RarD  35.81 
 
 		 319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3092  transporter DMT superfamily protein  37.76 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652908  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  35.2 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0297  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.55 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1952  rarD protein  36.7 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  35.2 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  36.21 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  36.21 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  36.21 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  35.83 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  36.18 
 
 		 296 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0604  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.06 
 
 		 307 aa  183  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.452707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  35.35 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  35.35 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  35.35 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  35.35 
 
 		 295 aa  182  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  35.35 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  35.35 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  35.35 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>