246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0080 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0080  RarD protein, DMT superfamily transporter  100 
 
 		 292 aa  568  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  50.18 
 
 		 302 aa  258  9e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  46.53 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1661  transporter DMT superfamily protein  46.5 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  46.62 
 
 		 335 aa  255  7e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0599  RarD protein, DMT superfamily transporter  46.21 
 
 		 302 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  45.18 
 
 		 294 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  45.32 
 
 		 308 aa  248  9e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0806  transporter DMT superfamily protein  44.72 
 
 		 300 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.86594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3395  RarD protein  47.77 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96482  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  44.1 
 
 		 313 aa  242  7e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  44.1 
 
 		 313 aa  242  7e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  44.1 
 
 		 313 aa  242  7e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  44.1 
 
 		 313 aa  242  7e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  44.1 
 
 		 313 aa  241  9e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  44.1 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  45.14 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0621  transporter DMT superfamily protein  41.96 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000105334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  44.1 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  44.44 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  44.1 
 
 		 313 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2317  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.4 
 
 		 305 aa  239  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000109763  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  43.94 
 
 		 294 aa  237  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  43.9 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  44.06 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0477  RarD protein, DMT superfamily transporter  47.37 
 
 		 298 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0490  RarD protein, DMT superfamily transporter  46.74 
 
 		 298 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.156296  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0570  hypothetical protein  47.72 
 
 		 298 aa  236  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  43.71 
 
 		 294 aa  236  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  45.45 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4403  RarD protein, DMT superfamily transporter  47.81 
 
 		 304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3544  RarD protein  45.91 
 
 		 304 aa  232  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.16 
 
 		 294 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  42.29 
 
 		 295 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  42.81 
 
 		 294 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  42.14 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  42.16 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  42.16 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2949  transporter DMT superfamily protein  48.78 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  42.16 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1350  rarD protein  47.93 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0535  transporter DMT superfamily protein  44.37 
 
 		 493 aa  230  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.595832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6667  RarD protein, DMT superfamily transporter  46.55 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605512  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  42.16 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  42.14 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.13 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0249  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.57 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  41.82 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  40.97 
 
 		 306 aa  222  6e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0297  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.85 
 
 		 301 aa  221  9e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0332  rarD protein  43.21 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  43.45 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2967  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.24 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.895178 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  41.88 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1859  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.52 
 
 		 310 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.898363  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2792  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.86 
 
 		 344 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  41.58 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  41.16 
 
 		 300 aa  215  7e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3092  transporter DMT superfamily protein  41.18 
 
 		 310 aa  215  7e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652908  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1247  transporter DMT superfamily protein  39.58 
 
 		 316 aa  215  8e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  0.0239516 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0190  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.36 
 
 		 306 aa  215  8e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0807  RarD protein, DMT superfamily transporter  47.31 
 
 		 301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00187361  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0811  RarD protein, DMT superfamily transporter  47.31 
 
 		 301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0657773  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3201  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.71 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.510387 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0891  transporter DMT superfamily protein  47.74 
 
 		 292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  39.3 
 
 		 304 aa  212  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.92 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2440  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.17 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.659696  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.61 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0719  transporter DMT superfamily protein  42.03 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0760  hypothetical protein  47.86 
 
 		 301 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3520  rarD protein  40.85 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0071  rarD protein  41.09 
 
 		 311 aa  209  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0239  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.06 
 
 		 306 aa  208  7e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1178  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.39 
 
 		 304 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00198  Conserved membrane protein RarD  42.6 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.493256  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23910  rarD protein  40.29 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00670263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1476  hypothetical protein  42.5 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0190  transporter DMT superfamily protein  41.58 
 
 		 295 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.7183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3677  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.48 
 
 		 320 aa  206  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02860  RarD protein  44.93 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  39.1 
 
 		 295 aa  206  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  38.6 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  40.14 
 
 		 297 aa  205  8e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  38.62 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.62 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  40.89 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  38.62 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  38.75 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  38.62 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4018  rarD protein  45.14 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  40.89 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  38.62 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  40.89 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  38.62 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  38.11 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1030  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.67 
 
 		 305 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0805  transporter DMT superfamily protein  47.35 
 
 		 298 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00148413  normal  0.0268128 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2425  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.84 
 
 		 309 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  38.64 
 
 		 301 aa  202  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>