254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1952 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1952  rarD protein  100 
 
 		 307 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0334  transporter DMT superfamily protein  66.32 
 
 		 298 aa  353  1e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2968  RarD protein  48.82 
 
 		 295 aa  249  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  45.36 
 
 		 303 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  42.71 
 
 		 295 aa  242  6e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  42.41 
 
 		 298 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  41.22 
 
 		 302 aa  238  8e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0717  transporter DMT superfamily protein  42.66 
 
 		 294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.424655  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  42.24 
 
 		 305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0190  transporter DMT superfamily protein  46.02 
 
 		 295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.7183 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  42.47 
 
 		 296 aa  232  6e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.47 
 
 		 296 aa  232  6e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  42.47 
 
 		 296 aa  232  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  42.47 
 
 		 296 aa  232  6e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  42.47 
 
 		 296 aa  232  6e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  42.47 
 
 		 296 aa  232  6e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  43.6 
 
 		 294 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0806  transporter DMT superfamily protein  45.64 
 
 		 300 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.86594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  42.32 
 
 		 295 aa  231  9e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  39.79 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  44.64 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  43.6 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  43.6 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  43.6 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  41.58 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  42.56 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  40.54 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  42.56 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  41.24 
 
 		 294 aa  229  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  41.24 
 
 		 295 aa  229  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  41.3 
 
 		 294 aa  229  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  43.25 
 
 		 298 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  42.21 
 
 		 295 aa  229  6e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  42.96 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  42.96 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  42.96 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  40.89 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  43.39 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0778  RarD protein  39.59 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  41.3 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2967  RarD protein, DMT superfamily transporter  46.83 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.895178 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.6 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.91 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.21 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  40.6 
 
 		 305 aa  225  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  44.07 
 
 		 297 aa  225  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.69 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_004310  BR0680  rarD protein  41.96 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.667831  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  39.04 
 
 		 300 aa  223  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  40.69 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  40.69 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  40.55 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  43.64 
 
 		 295 aa  222  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00198  Conserved membrane protein RarD  43.71 
 
 		 310 aa  221  8e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.493256  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.22 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0672  RarD protein  42.5 
 
 		 290 aa  219  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1661  transporter DMT superfamily protein  41.4 
 
 		 297 aa  219  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  41.5 
 
 		 306 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0719  transporter DMT superfamily protein  39.93 
 
 		 313 aa  218  8.999999999999998e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1207  rarD protein  38.44 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.89 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4080  transporter DMT superfamily protein  43.26 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1030  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.05 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1178  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.72 
 
 		 304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  43.2 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0152  RarD protein  40.22 
 
 		 276 aa  216  4e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.886029  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.86 
 
 		 295 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  42.86 
 
 		 295 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  43.71 
 
 		 294 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0190  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.26 
 
 		 306 aa  215  7e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0970  transporter DMT superfamily protein  41.5 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0101189  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2608  transporter DMT superfamily protein  41.67 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  41 
 
 		 335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1350  rarD protein  41.58 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1428  rarD protein  44.44 
 
 		 304 aa  212  5.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.242387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0795  RarD protein  40.28 
 
 		 292 aa  211  9e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0595503  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0332  rarD protein  41.5 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1183  DMT superfamily efflux pump, RarD  39.12 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0239  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.91 
 
 		 306 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0706  RarD protein  44.48 
 
 		 310 aa  209  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  40.91 
 
 		 300 aa  208  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0796  RarD protein  36.01 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000337641  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0588  hypothetical protein  43.4 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0009394  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3201  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.6 
 
 		 333 aa  207  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.510387 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  36.93 
 
 		 301 aa  205  7e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0071  rarD protein  38.89 
 
 		 311 aa  205  7e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0760  hypothetical protein  46.98 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1247  transporter DMT superfamily protein  37.22 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  0.0239516 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0807  RarD protein, DMT superfamily transporter  46.13 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00187361  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0811  RarD protein, DMT superfamily transporter  46.13 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0657773  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  37.1 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  42.5 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4844  transporter DMT superfamily protein  44.67 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000446481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2792  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.27 
 
 		 344 aa  203  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2776  transporter DMT superfamily protein  36.93 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2719  transporter DMT superfamily protein  36.93 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06320  hypothetical protein  42.36 
 
 		 298 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257668  normal  0.652211 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0851  RarD protein  36.36 
 
 		 292 aa  202  5e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0193705  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  37.46 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  37.46 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>