261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4157 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  100 
 
 		 309 aa  617  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  97.09 
 
 		 309 aa  605  9.999999999999999e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0190  transporter DMT superfamily protein  78.98 
 
 		 295 aa  468  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.7183 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  77.03 
 
 		 296 aa  461  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  77.03 
 
 		 296 aa  461  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  77.03 
 
 		 296 aa  461  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  73.04 
 
 		 295 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  72.54 
 
 		 298 aa  454  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  73.04 
 
 		 295 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  73.04 
 
 		 295 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  73.04 
 
 		 294 aa  454  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  70.27 
 
 		 296 aa  448  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  70.27 
 
 		 296 aa  448  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  70.27 
 
 		 296 aa  448  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  70.27 
 
 		 296 aa  448  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  70.99 
 
 		 295 aa  447  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  70.27 
 
 		 296 aa  448  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  70.27 
 
 		 296 aa  448  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  71.28 
 
 		 298 aa  451  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  70.65 
 
 		 295 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  70.85 
 
 		 301 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0239  RarD protein, DMT superfamily transporter  71.95 
 
 		 306 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0190  RarD protein, DMT superfamily transporter  70.3 
 
 		 306 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  60.07 
 
 		 304 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  61.26 
 
 		 305 aa  383  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  59.12 
 
 		 305 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  57.09 
 
 		 302 aa  359  4e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  58.78 
 
 		 295 aa  348  8e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  58.78 
 
 		 298 aa  344  8.999999999999999e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  55.48 
 
 		 294 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  55.52 
 
 		 294 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  59.31 
 
 		 295 aa  338  9e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  55.48 
 
 		 294 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  55.48 
 
 		 294 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  55.48 
 
 		 294 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  55.82 
 
 		 294 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  54.58 
 
 		 295 aa  334  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  54.79 
 
 		 294 aa  333  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  54.45 
 
 		 294 aa  331  8e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  56.62 
 
 		 302 aa  328  9e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  55.74 
 
 		 296 aa  325  6e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  52.19 
 
 		 300 aa  317  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0332  rarD protein  56.84 
 
 		 293 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100395  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  54.36 
 
 		 300 aa  313  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  49.51 
 
 		 306 aa  289  4e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0717  transporter DMT superfamily protein  49.49 
 
 		 294 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.424655  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00198  Conserved membrane protein RarD  51.01 
 
 		 310 aa  281  9e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.493256  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  45.21 
 
 		 304 aa  262  6e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  47.32 
 
 		 295 aa  256  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  46.28 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  46.62 
 
 		 295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  46.28 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  45.99 
 
 		 294 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.78 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  46.64 
 
 		 297 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0588  hypothetical protein  47.18 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0009394  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06320  hypothetical protein  47.18 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257668  normal  0.652211 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  45.1 
 
 		 303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  42.67 
 
 		 335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1350  rarD protein  43.49 
 
 		 300 aa  239  5e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  42.19 
 
 		 313 aa  238  8e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  42.19 
 
 		 313 aa  237  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  42.19 
 
 		 313 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  42.19 
 
 		 313 aa  237  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  42.19 
 
 		 313 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  42.19 
 
 		 313 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  42.19 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2967  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.42 
 
 		 304 aa  236  3e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.895178 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0806  transporter DMT superfamily protein  43.96 
 
 		 300 aa  236  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.86594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  41.78 
 
 		 313 aa  236  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  43.71 
 
 		 313 aa  236  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1661  transporter DMT superfamily protein  43.58 
 
 		 297 aa  235  8e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  42.11 
 
 		 315 aa  234  9e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.56 
 
 		 307 aa  234  9e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0621  transporter DMT superfamily protein  44.03 
 
 		 318 aa  235  9e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000105334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  41.86 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  45.23 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4844  transporter DMT superfamily protein  45.95 
 
 		 295 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000446481  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0483  rarD protein  46.64 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000325655  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.22 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  40.39 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2317  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.27 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000109763  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1859  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.1 
 
 		 310 aa  225  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.898363  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3092  transporter DMT superfamily protein  41.44 
 
 		 310 aa  223  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652908  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.62 
 
 		 302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2719  transporter DMT superfamily protein  39.67 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2776  transporter DMT superfamily protein  39.67 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3395  RarD protein  43.62 
 
 		 301 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96482  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1952  rarD protein  42.56 
 
 		 307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4698  RarD protein  46.15 
 
 		 295 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000777154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0477  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.93 
 
 		 298 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05950  hypothetical protein, RarD family  48.84 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  unclonable  0.0000000220659  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0490  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.67 
 
 		 298 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.156296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2792  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.38 
 
 		 344 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0811  RarD protein, DMT superfamily transporter  47.46 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0657773  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0807  RarD protein, DMT superfamily transporter  47.46 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00187361  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0071  rarD protein  37.62 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1183  DMT superfamily efflux pump, RarD  41 
 
 		 319 aa  212  7e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1207  rarD protein  40 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4080  transporter DMT superfamily protein  42.49 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.44689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>