245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4018 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4018  rarD protein  100 
 
 		 316 aa  620  1e-177  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0891  transporter DMT superfamily protein  68.06 
 
 		 292 aa  345  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3395  RarD protein  55.86 
 
 		 301 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96482  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  55.17 
 
 		 294 aa  305  7e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  53.74 
 
 		 335 aa  295  5e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0570  hypothetical protein  55.94 
 
 		 298 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3544  RarD protein  55.83 
 
 		 304 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  54.58 
 
 		 308 aa  278  8e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0477  RarD protein, DMT superfamily transporter  55.59 
 
 		 298 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0490  RarD protein, DMT superfamily transporter  55.59 
 
 		 298 aa  269  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.156296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2949  transporter DMT superfamily protein  55.28 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  51.57 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1661  transporter DMT superfamily protein  49.47 
 
 		 297 aa  246  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0599  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.75 
 
 		 302 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  42.81 
 
 		 303 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  43.45 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  43 
 
 		 315 aa  236  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  43.39 
 
 		 313 aa  235  7e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  43.05 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0717  transporter DMT superfamily protein  43.34 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.424655  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  43.05 
 
 		 313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  41.98 
 
 		 313 aa  232  6e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  41.98 
 
 		 313 aa  232  6e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  41.98 
 
 		 313 aa  232  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  41.98 
 
 		 313 aa  232  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  41.98 
 
 		 313 aa  232  6e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  43.05 
 
 		 313 aa  232  6e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  43.67 
 
 		 298 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  42.18 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00198  Conserved membrane protein RarD  46.39 
 
 		 310 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.493256  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  42.27 
 
 		 294 aa  229  5e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  42.61 
 
 		 294 aa  229  5e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  43.84 
 
 		 300 aa  229  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  42.36 
 
 		 295 aa  229  6e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  41.96 
 
 		 296 aa  229  7e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  46.62 
 
 		 295 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  41.98 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  42.96 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  42.91 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  41.64 
 
 		 294 aa  226  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0249  RarD protein, DMT superfamily transporter  46.08 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  43.4 
 
 		 304 aa  225  8e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  37.54 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.96 
 
 		 294 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  41.58 
 
 		 294 aa  223  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  41.96 
 
 		 294 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  42.11 
 
 		 294 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  41.96 
 
 		 294 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  46 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0588  hypothetical protein  46.1 
 
 		 298 aa  222  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0009394  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  46.26 
 
 		 295 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3201  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.49 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.510387 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0190  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.58 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  45.39 
 
 		 295 aa  220  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4844  transporter DMT superfamily protein  47.69 
 
 		 295 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000446481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06320  hypothetical protein  45.74 
 
 		 298 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257668  normal  0.652211 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  41.22 
 
 		 305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  45.91 
 
 		 295 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0604  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.66 
 
 		 307 aa  219  7e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.452707  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1247  transporter DMT superfamily protein  38.66 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  0.0239516 
 
 
-
 
NC_004310  BR0680  rarD protein  42.05 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.667831  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.14 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0806  transporter DMT superfamily protein  43.3 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.86594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  42.12 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  42.26 
 
 		 302 aa  216  5e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0940  transporter DMT superfamily protein  49.83 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  40.62 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0332  rarD protein  43.21 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0672  RarD protein  43.37 
 
 		 290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1110  transporter DMT superfamily protein  45.15 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2608  transporter DMT superfamily protein  40.72 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.45 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2967  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.61 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.895178 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2776  transporter DMT superfamily protein  36.86 
 
 		 302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2719  transporter DMT superfamily protein  36.86 
 
 		 302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  41.67 
 
 		 301 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3677  RarD protein, DMT superfamily transporter  49.65 
 
 		 320 aa  212  5.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  41.46 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0080  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.14 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  41.61 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.61 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  41.61 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  41.61 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1350  rarD protein  41.72 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  41.61 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  41.11 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  41.61 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0621  transporter DMT superfamily protein  39.5 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000105334  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.11 
 
 		 307 aa  209  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0239  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.95 
 
 		 306 aa  209  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  37.59 
 
 		 304 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0483  rarD protein  47 
 
 		 295 aa  208  8e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000325655  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0297  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.79 
 
 		 301 aa  208  9e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  44.1 
 
 		 296 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1207  rarD protein  37.79 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  44.1 
 
 		 296 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.11 
 
 		 307 aa  207  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  44.1 
 
 		 296 aa  208  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02860  RarD protein  45.1 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7674  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.49 
 
 		 332 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>