245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7674 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7674  RarD protein, DMT superfamily transporter  100 
 
 		 332 aa  642    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0599  RarD protein, DMT superfamily transporter  60.68 
 
 		 302 aa  346  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4403  RarD protein, DMT superfamily transporter  59.38 
 
 		 304 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0297  RarD protein, DMT superfamily transporter  57.79 
 
 		 301 aa  299  5e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0535  transporter DMT superfamily protein  55.07 
 
 		 493 aa  282  5.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.595832  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1003  RarD protein, DMT superfamily transporter  54.3 
 
 		 319 aa  259  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3201  RarD protein, DMT superfamily transporter  50.99 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.510387 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07630  rarD protein  53.7 
 
 		 314 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0527752 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5070  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.73 
 
 		 351 aa  255  8e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0604  RarD protein, DMT superfamily transporter  48.73 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.452707  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6667  RarD protein, DMT superfamily transporter  48.31 
 
 		 313 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605512  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3092  transporter DMT superfamily protein  47.8 
 
 		 310 aa  246  4e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652908  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0775  RarD protein, DMT superfamily transporter  55.52 
 
 		 305 aa  241  9e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2440  RarD protein, DMT superfamily transporter  50 
 
 		 311 aa  240  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.659696  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1661  transporter DMT superfamily protein  43.79 
 
 		 297 aa  238  9e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0466  transporter DMT superfamily protein  51.93 
 
 		 316 aa  236  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2792  RarD protein, DMT superfamily transporter  47.22 
 
 		 344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0394  transporter DMT superfamily protein  52.36 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  43.45 
 
 		 294 aa  232  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2679  RarD protein  46.58 
 
 		 312 aa  228  8e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  40.37 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0249  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.89 
 
 		 298 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2699  RarD protein, DMT superfamily transporter  51.51 
 
 		 302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  46.74 
 
 		 302 aa  225  7e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0080  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.49 
 
 		 292 aa  225  8e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3395  RarD protein  44.07 
 
 		 301 aa  225  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96482  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.28 
 
 		 295 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  41.95 
 
 		 295 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  36.89 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  41.95 
 
 		 295 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4018  rarD protein  43.49 
 
 		 316 aa  219  6e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0477  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.62 
 
 		 298 aa  219  6e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  38.41 
 
 		 298 aa  219  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0588  hypothetical protein  42 
 
 		 298 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0009394  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0490  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.62 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.156296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06320  hypothetical protein  41.67 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257668  normal  0.652211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3414  RarD protein, DMT superfamily transporter  46.33 
 
 		 312 aa  217  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  40.13 
 
 		 295 aa  215  8e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  39.93 
 
 		 306 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0190  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.98 
 
 		 306 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  42.14 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  42.38 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3544  RarD protein  40.91 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  40 
 
 		 295 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  37.76 
 
 		 305 aa  212  5.999999999999999e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  37.95 
 
 		 313 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  39.67 
 
 		 295 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  40.13 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.13 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  40.13 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  40.13 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  40.13 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  40.13 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  40 
 
 		 301 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  37.42 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  37.42 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  37.42 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  37.42 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  38.8 
 
 		 295 aa  210  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0570  hypothetical protein  43.96 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  37.42 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  37.42 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  40.97 
 
 		 308 aa  209  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  39.8 
 
 		 304 aa  209  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  37.75 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1859  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.55 
 
 		 310 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.898363  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  37.42 
 
 		 313 aa  209  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  36.89 
 
 		 296 aa  208  8e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  39.8 
 
 		 297 aa  208  9e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  38.87 
 
 		 295 aa  208  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  40.67 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  40.33 
 
 		 294 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  40.67 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  40.67 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21390  rarD protein  43.93 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580416 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0621  transporter DMT superfamily protein  35.48 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000105334  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  40.8 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05950  hypothetical protein, RarD family  46.67 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  unclonable  0.0000000220659  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  40.8 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  40.8 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  39.4 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0239  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.81 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0891  transporter DMT superfamily protein  43.3 
 
 		 292 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  40.8 
 
 		 298 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4844  transporter DMT superfamily protein  43.29 
 
 		 295 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000446481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2317  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.92 
 
 		 305 aa  206  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000109763  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.16 
 
 		 309 aa  205  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  41.06 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  37.62 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.16 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  34.85 
 
 		 313 aa  202  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2967  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.12 
 
 		 304 aa  202  6e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.895178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  35.33 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2949  transporter DMT superfamily protein  42.76 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1183  DMT superfamily efflux pump, RarD  34.11 
 
 		 319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0829  RarD protein, DMT superfamily transporter  37.75 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.412123  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  36.46 
 
 		 294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  36.46 
 
 		 294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23910  rarD protein  39.94 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00670263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  35.41 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>