242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0775 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0775  RarD protein, DMT superfamily transporter  100 
 
 		 305 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0599  RarD protein, DMT superfamily transporter  56.19 
 
 		 302 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0297  RarD protein, DMT superfamily transporter  57.81 
 
 		 301 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4403  RarD protein, DMT superfamily transporter  57.45 
 
 		 304 aa  292  4e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2792  RarD protein, DMT superfamily transporter  55.05 
 
 		 344 aa  282  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3092  transporter DMT superfamily protein  53.16 
 
 		 310 aa  282  5.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652908  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0535  transporter DMT superfamily protein  53.82 
 
 		 493 aa  273  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.595832  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2699  RarD protein, DMT superfamily transporter  59.41 
 
 		 302 aa  272  5.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3201  RarD protein, DMT superfamily transporter  53.27 
 
 		 333 aa  269  4e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.510387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7674  RarD protein, DMT superfamily transporter  55.02 
 
 		 332 aa  264  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2440  RarD protein, DMT superfamily transporter  52.11 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.659696  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0466  transporter DMT superfamily protein  55.2 
 
 		 316 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0394  transporter DMT superfamily protein  56.55 
 
 		 321 aa  257  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.38 
 
 		 309 aa  256  5e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1003  RarD protein, DMT superfamily transporter  52.38 
 
 		 319 aa  254  9e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  46.48 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3414  RarD protein, DMT superfamily transporter  51.56 
 
 		 312 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5070  RarD protein, DMT superfamily transporter  47.24 
 
 		 351 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  46.82 
 
 		 335 aa  245  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6667  RarD protein, DMT superfamily transporter  50.33 
 
 		 313 aa  245  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605512  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0806  transporter DMT superfamily protein  45.99 
 
 		 300 aa  242  6e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.86594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07630  rarD protein  54.15 
 
 		 314 aa  241  9e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0527752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1350  rarD protein  46.51 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0604  RarD protein, DMT superfamily transporter  50.34 
 
 		 307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.452707  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  45.77 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  41.32 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  48.15 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  41.89 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2967  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.36 
 
 		 304 aa  236  4e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.895178 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  41.95 
 
 		 304 aa  235  8e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2317  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.42 
 
 		 305 aa  235  9e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000109763  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  45.26 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  41.81 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3395  RarD protein  45.39 
 
 		 301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96482  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  41.22 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21390  rarD protein  50.52 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580416 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  41.47 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  41.47 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  41.87 
 
 		 296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  38.93 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.1 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  40.94 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0936  rarD protein  44.6 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1661  transporter DMT superfamily protein  43.66 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00198  Conserved membrane protein RarD  41.75 
 
 		 310 aa  229  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.493256  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.27 
 
 		 294 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  41.87 
 
 		 313 aa  229  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.41 
 
 		 307 aa  228  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  41.87 
 
 		 313 aa  228  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  40.2 
 
 		 302 aa  228  9e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  41.18 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  41.18 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  41.18 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  41.18 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0334  transporter DMT superfamily protein  45.67 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  41.52 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  41.52 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  41.18 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  39.19 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  39.19 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.48 
 
 		 295 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0332  rarD protein  44.06 
 
 		 293 aa  226  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  39.45 
 
 		 294 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0249  RarD protein, DMT superfamily transporter  47.14 
 
 		 298 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  40.07 
 
 		 294 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  43.77 
 
 		 296 aa  225  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  43.77 
 
 		 296 aa  225  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  43.77 
 
 		 296 aa  225  6e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2679  RarD protein  45.21 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  40.07 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  43.9 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3638  transporter DMT superfamily protein  52.88 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0490  RarD protein, DMT superfamily transporter  46.44 
 
 		 298 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.156296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  41.47 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  38.16 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  39.73 
 
 		 295 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.45 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  44.25 
 
 		 295 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3544  RarD protein  43.64 
 
 		 304 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0477  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.76 
 
 		 298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.79 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  39.79 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  44.14 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  42.91 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0080  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.25 
 
 		 292 aa  219  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  41.41 
 
 		 294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0588  hypothetical protein  43.36 
 
 		 298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0009394  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  38.54 
 
 		 300 aa  218  7e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  38.85 
 
 		 296 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.85 
 
 		 296 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  38.85 
 
 		 296 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  39.26 
 
 		 301 aa  218  7.999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  38.85 
 
 		 296 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  41.1 
 
 		 295 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  38.85 
 
 		 296 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  41.1 
 
 		 295 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  38.85 
 
 		 296 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  41.1 
 
 		 295 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  39.38 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  39.38 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>