242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1003 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1003  RarD protein, DMT superfamily transporter  100 
 
 		 319 aa  616  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0599  RarD protein, DMT superfamily transporter  57.34 
 
 		 302 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0535  transporter DMT superfamily protein  55.87 
 
 		 493 aa  299  5e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.595832  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4403  RarD protein, DMT superfamily transporter  57.75 
 
 		 304 aa  293  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0297  RarD protein, DMT superfamily transporter  55.6 
 
 		 301 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6667  RarD protein, DMT superfamily transporter  55.28 
 
 		 313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605512  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3092  transporter DMT superfamily protein  50.51 
 
 		 310 aa  272  6e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652908  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07630  rarD protein  53.04 
 
 		 314 aa  265  5.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0527752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7674  RarD protein, DMT superfamily transporter  54.3 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3201  RarD protein, DMT superfamily transporter  49.51 
 
 		 333 aa  252  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.510387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0604  RarD protein, DMT superfamily transporter  48.99 
 
 		 307 aa  245  6.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.452707  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2792  RarD protein, DMT superfamily transporter  46.81 
 
 		 344 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5070  RarD protein, DMT superfamily transporter  49.82 
 
 		 351 aa  239  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2679  RarD protein  50 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2440  RarD protein, DMT superfamily transporter  48.39 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.659696  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  46.85 
 
 		 302 aa  232  8.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0775  RarD protein, DMT superfamily transporter  53.02 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0477  RarD protein, DMT superfamily transporter  46.21 
 
 		 298 aa  228  7e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0490  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.79 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.156296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0080  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.06 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1661  transporter DMT superfamily protein  43.6 
 
 		 297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  44.37 
 
 		 294 aa  225  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0071  rarD protein  42.47 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  40.75 
 
 		 298 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  40.28 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3414  RarD protein, DMT superfamily transporter  46.26 
 
 		 312 aa  223  4e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.45 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  43.45 
 
 		 294 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  43.45 
 
 		 294 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  39.79 
 
 		 295 aa  220  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3638  transporter DMT superfamily protein  51.46 
 
 		 296 aa  220  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21390  rarD protein  45.89 
 
 		 334 aa  219  5e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580416 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  39.3 
 
 		 335 aa  219  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  43.1 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  39.93 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  39.93 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  39.93 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  40.27 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  39.93 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  39.93 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  43.4 
 
 		 294 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  39.93 
 
 		 313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2699  RarD protein, DMT superfamily transporter  50.35 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  42.41 
 
 		 294 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  41.18 
 
 		 294 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  40.83 
 
 		 295 aa  216  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  39.59 
 
 		 313 aa  215  7e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  39.93 
 
 		 313 aa  215  7e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.59 
 
 		 307 aa  215  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  40.83 
 
 		 294 aa  215  8e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  40.14 
 
 		 313 aa  215  9e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17690  rarD protein  45 
 
 		 336 aa  215  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  42.47 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0588  hypothetical protein  43.36 
 
 		 298 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0009394  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  38.57 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  40.14 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  42.56 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.56 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.12 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  42.56 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  42.56 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  42.56 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  42.56 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06320  hypothetical protein  43.01 
 
 		 298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257668  normal  0.652211 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0655  RarD protein, DMT superfamily transporter  48.62 
 
 		 336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.517971  normal  0.350174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  42.12 
 
 		 295 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  42.21 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.26 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0719  transporter DMT superfamily protein  40.2 
 
 		 313 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  40.88 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  39.67 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  40.96 
 
 		 303 aa  210  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  41.87 
 
 		 295 aa  210  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0466  transporter DMT superfamily protein  49.46 
 
 		 316 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  37.92 
 
 		 305 aa  209  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  42.07 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0680  rarD protein  38.68 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.667831  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1859  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.1 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.898363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  39.25 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.24 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  38.85 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.26 
 
 		 309 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1476  hypothetical protein  39.26 
 
 		 307 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0249  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.91 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2775  transporter DMT superfamily protein  50 
 
 		 296 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.826427  normal  0.361103 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.91 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  40.75 
 
 		 295 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0394  transporter DMT superfamily protein  49.65 
 
 		 321 aa  206  6e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  38.23 
 
 		 300 aa  205  7e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3091  rarD protein  48.11 
 
 		 312 aa  205  9e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3151  transporter DMT superfamily protein  48.11 
 
 		 312 aa  205  9e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.224678 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3111  transporter DMT superfamily protein  48.11 
 
 		 312 aa  205  9e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1207  rarD protein  37.09 
 
 		 319 aa  205  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  39.46 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0570  hypothetical protein  43.79 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2608  transporter DMT superfamily protein  36.31 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3395  RarD protein  42.09 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96482  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1030  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.54 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  42.21 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  41.67 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>