258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_17690 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_17690  rarD protein  100 
 
 
336 aa  643    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3092  transporter DMT superfamily protein  52.96 
 
 
310 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652908  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2792  RarD protein, DMT superfamily transporter  51.4 
 
 
344 aa  263  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0599  RarD protein, DMT superfamily transporter  47.96 
 
 
302 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21390  rarD protein  49.83 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000580416 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3201  RarD protein, DMT superfamily transporter  46.36 
 
 
333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.510387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0604  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.77 
 
 
307 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.452707  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2699  RarD protein, DMT superfamily transporter  51.36 
 
 
302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6667  RarD protein, DMT superfamily transporter  46.44 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605512  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0535  transporter DMT superfamily protein  43.73 
 
 
493 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.595832  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3414  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.56 
 
 
312 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07630  rarD protein  48.84 
 
 
314 aa  212  9e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0527752 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0297  RarD protein, DMT superfamily transporter  46.69 
 
 
301 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.14 
 
 
295 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  42.43 
 
 
295 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  43.79 
 
 
295 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  44.14 
 
 
295 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4403  RarD protein, DMT superfamily transporter  47.55 
 
 
304 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1003  RarD protein, DMT superfamily transporter  45 
 
 
319 aa  202  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5070  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.06 
 
 
351 aa  202  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  43.1 
 
 
335 aa  202  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  40.97 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.97 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  40.97 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  40.89 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  40.97 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  40.97 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  40.97 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  40.97 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  40.62 
 
 
295 aa  199  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  41.36 
 
 
296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  41.36 
 
 
296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  41.36 
 
 
296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  41.24 
 
 
298 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0071  rarD protein  39.61 
 
 
311 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  40.77 
 
 
294 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  40.77 
 
 
295 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  40.77 
 
 
295 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  40.77 
 
 
295 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  38.03 
 
 
302 aa  193  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.68 
 
 
309 aa  192  7e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  41.44 
 
 
297 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  37.63 
 
 
295 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.34 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0936  rarD protein  40.48 
 
 
295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06320  hypothetical protein  41.16 
 
 
298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257668  normal  0.652211 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0829  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.22 
 
 
307 aa  189  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.412123  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0588  hypothetical protein  40.94 
 
 
298 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0009394  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  40.13 
 
 
298 aa  189  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0190  transporter DMT superfamily protein  40.14 
 
 
295 aa  188  9e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.7183 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  38.38 
 
 
294 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  37.59 
 
 
294 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  37.59 
 
 
294 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  36.73 
 
 
298 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  36.86 
 
 
295 aa  186  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.03 
 
 
294 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.48 
 
 
307 aa  185  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0080  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.78 
 
 
292 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0190  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.23 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  38.03 
 
 
294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  38.03 
 
 
294 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0239  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.96 
 
 
306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  38.03 
 
 
294 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  38.03 
 
 
294 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2679  RarD protein  41.44 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  36.86 
 
 
296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  38.83 
 
 
303 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4844  transporter DMT superfamily protein  42.86 
 
 
295 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000446481  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3544  RarD protein  39.38 
 
 
304 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0655  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.39 
 
 
336 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.517971  normal  0.350174 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  32.65 
 
 
300 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  36.18 
 
 
304 aa  179  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.79 
 
 
307 aa  179  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0483  rarD protein  42.14 
 
 
295 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000325655  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0806  transporter DMT superfamily protein  40.33 
 
 
300 aa  179  7e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.86594  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3395  RarD protein  38.38 
 
 
301 aa  179  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96482  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  42.34 
 
 
308 aa  178  9e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0775  RarD protein, DMT superfamily transporter  47.22 
 
 
305 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1428  rarD protein  40.2 
 
 
304 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.242387  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  36.63 
 
 
305 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3677  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.56 
 
 
320 aa  177  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  33.89 
 
 
295 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  35.25 
 
 
309 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7674  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.19 
 
 
332 aa  176  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1350  rarD protein  41.32 
 
 
300 aa  176  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2608  transporter DMT superfamily protein  39.19 
 
 
325 aa  175  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0332  rarD protein  37.32 
 
 
293 aa  175  9e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100395  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0477  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.2 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1183  DMT superfamily efflux pump, RarD  35.41 
 
 
319 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  35.45 
 
 
300 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1207  rarD protein  35.74 
 
 
319 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2949  transporter DMT superfamily protein  41.87 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1661  transporter DMT superfamily protein  37.58 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0490  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.22 
 
 
298 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.156296  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  32.67 
 
 
305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  33.9 
 
 
315 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  33.33 
 
 
301 aa  171  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0680  rarD protein  37.41 
 
 
306 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.667831  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.69 
 
 
302 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  36.33 
 
 
294 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>