243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5070 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5070  RarD protein, DMT superfamily transporter  100 
 
 		 351 aa  692    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0599  RarD protein, DMT superfamily transporter  52.03 
 
 		 302 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2679  RarD protein  56.48 
 
 		 312 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0297  RarD protein, DMT superfamily transporter  51.4 
 
 		 301 aa  269  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3092  transporter DMT superfamily protein  43.83 
 
 		 310 aa  245  8e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652908  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3201  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.78 
 
 		 333 aa  245  8e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.510387 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4403  RarD protein, DMT superfamily transporter  49.65 
 
 		 304 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7674  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.39 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2792  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.55 
 
 		 344 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6667  RarD protein, DMT superfamily transporter  48.08 
 
 		 313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605512  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2699  RarD protein, DMT superfamily transporter  47.3 
 
 		 302 aa  220  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0535  transporter DMT superfamily protein  43.94 
 
 		 493 aa  216  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.595832  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1661  transporter DMT superfamily protein  40.07 
 
 		 297 aa  213  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  36.72 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  36.39 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  36.39 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  36.39 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  36.39 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0604  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.77 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.452707  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  36.39 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  36.72 
 
 		 313 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  37.05 
 
 		 313 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  37.05 
 
 		 313 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1003  RarD protein, DMT superfamily transporter  49.82 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  36.72 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3395  RarD protein  40.4 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96482  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  35.2 
 
 		 315 aa  207  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0466  transporter DMT superfamily protein  47.35 
 
 		 316 aa  203  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2440  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.34 
 
 		 311 aa  202  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.659696  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0394  transporter DMT superfamily protein  43.5 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  35.23 
 
 		 309 aa  199  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.82 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0775  RarD protein, DMT superfamily transporter  47.04 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  38.46 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  38.52 
 
 		 308 aa  195  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07630  rarD protein  45.36 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0527752 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  38.18 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  37.33 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3544  RarD protein  39.86 
 
 		 304 aa  193  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  36.84 
 
 		 298 aa  192  9e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  35.19 
 
 		 300 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  36.97 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  36.27 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  37.28 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  36.97 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0829  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.26 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.412123  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  36.27 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  36.27 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  36.62 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  36.62 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3414  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.58 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  36.62 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1207  rarD protein  33.22 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  33.92 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  36.62 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  33.55 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0080  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.28 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  36.27 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  38.03 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  36.62 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1183  DMT superfamily efflux pump, RarD  32.56 
 
 		 319 aa  187  3e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  35.79 
 
 		 295 aa  187  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17690  rarD protein  42.81 
 
 		 336 aa  187  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  37.28 
 
 		 294 aa  186  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21390  rarD protein  39.38 
 
 		 334 aa  186  7e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580416 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  35.54 
 
 		 296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  35.54 
 
 		 296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  35.54 
 
 		 296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  35.54 
 
 		 296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  35.54 
 
 		 296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  35.54 
 
 		 295 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  35.54 
 
 		 296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0249  RarD protein, DMT superfamily transporter  37.41 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0332  rarD protein  37.41 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  34.78 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.79 
 
 		 307 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.79 
 
 		 307 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  35.19 
 
 		 295 aa  184  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0621  transporter DMT superfamily protein  33.56 
 
 		 318 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000105334  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0477  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.03 
 
 		 298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  33.66 
 
 		 309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  36.97 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1859  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.45 
 
 		 310 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.898363  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  34.34 
 
 		 309 aa  182  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0806  transporter DMT superfamily protein  35.96 
 
 		 300 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.86594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  32.78 
 
 		 301 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  35.43 
 
 		 306 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2317  RarD protein, DMT superfamily transporter  35.66 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000109763  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02860  RarD protein  41.26 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  33.9 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  35.14 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0490  RarD protein, DMT superfamily transporter  36.61 
 
 		 298 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.156296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0936  rarD protein  40.69 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0239  RarD protein, DMT superfamily transporter  35.74 
 
 		 306 aa  176  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  34.97 
 
 		 294 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  35.56 
 
 		 298 aa  176  7e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0190  RarD protein, DMT superfamily transporter  37.06 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3091  rarD protein  43 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381827  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  34.97 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3111  transporter DMT superfamily protein  43 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177004  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>