258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2792 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2792  RarD protein, DMT superfamily transporter  100 
 
 		 344 aa  667    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3092  transporter DMT superfamily protein  82.39 
 
 		 310 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652908  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0599  RarD protein, DMT superfamily transporter  54.55 
 
 		 302 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3201  RarD protein, DMT superfamily transporter  49.67 
 
 		 333 aa  275  7e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.510387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0535  transporter DMT superfamily protein  48.95 
 
 		 493 aa  275  7e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.595832  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0604  RarD protein, DMT superfamily transporter  46.67 
 
 		 307 aa  265  8e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.452707  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2699  RarD protein, DMT superfamily transporter  54.33 
 
 		 302 aa  262  6e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17690  rarD protein  48.76 
 
 		 336 aa  258  7e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07630  rarD protein  48.33 
 
 		 314 aa  258  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0527752 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3414  RarD protein, DMT superfamily transporter  46.6 
 
 		 312 aa  251  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6667  RarD protein, DMT superfamily transporter  51.03 
 
 		 313 aa  249  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605512  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0297  RarD protein, DMT superfamily transporter  48.57 
 
 		 301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21390  rarD protein  47.44 
 
 		 334 aa  238  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580416 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2679  RarD protein  46.53 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0655  RarD protein, DMT superfamily transporter  51.96 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.517971  normal  0.350174 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0775  RarD protein, DMT superfamily transporter  55.05 
 
 		 305 aa  235  8e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4403  RarD protein, DMT superfamily transporter  50 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1003  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.31 
 
 		 319 aa  233  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.91 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5070  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.79 
 
 		 351 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  42.37 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  42.37 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  42.37 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.39 
 
 		 302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.46 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  43.26 
 
 		 308 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.67 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  40.62 
 
 		 335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  39.93 
 
 		 298 aa  219  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0466  transporter DMT superfamily protein  51.08 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0394  transporter DMT superfamily protein  51.92 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0190  transporter DMT superfamily protein  40.34 
 
 		 295 aa  216  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.7183 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  37.5 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  38.78 
 
 		 295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0080  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.76 
 
 		 292 aa  212  7e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7674  RarD protein, DMT superfamily transporter  47.28 
 
 		 332 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3395  RarD protein  42.76 
 
 		 301 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96482  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  39.86 
 
 		 303 aa  210  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  39.22 
 
 		 302 aa  210  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2317  RarD protein, DMT superfamily transporter  37.25 
 
 		 305 aa  209  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000109763  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0806  transporter DMT superfamily protein  39.46 
 
 		 300 aa  209  5e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.86594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  39.02 
 
 		 313 aa  209  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1476  hypothetical protein  40.86 
 
 		 307 aa  208  9e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  37.05 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  37.97 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  39.74 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.62 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  42.07 
 
 		 295 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0239  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.4 
 
 		 306 aa  207  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  37.37 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  37.37 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  37.37 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  37.37 
 
 		 295 aa  206  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  37.37 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  37.37 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  37.37 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0190  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.55 
 
 		 306 aa  206  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00198  Conserved membrane protein RarD  39.12 
 
 		 310 aa  206  5e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.493256  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.28 
 
 		 307 aa  206  6e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  39.51 
 
 		 294 aa  205  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  36.39 
 
 		 313 aa  205  9e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  36.39 
 
 		 313 aa  205  9e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  36.39 
 
 		 313 aa  205  9e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  36.39 
 
 		 313 aa  205  9e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  37.04 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  36.39 
 
 		 313 aa  205  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  36.72 
 
 		 313 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  37.5 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  36.39 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  38.68 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  36.39 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  38.18 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  38.82 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  37.54 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  38.18 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  38.33 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  38.18 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0332  rarD protein  40.21 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  36.58 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  38.85 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.73 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  37.84 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1661  transporter DMT superfamily protein  42.55 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  40.4 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  38.31 
 
 		 295 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2949  transporter DMT superfamily protein  45.26 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  38.31 
 
 		 298 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0829  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.06 
 
 		 307 aa  203  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.412123  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  37.46 
 
 		 304 aa  202  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  37.98 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  40.4 
 
 		 295 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  37.97 
 
 		 298 aa  202  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  38.05 
 
 		 295 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2967  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.93 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.895178 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  37.63 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  37.37 
 
 		 294 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  37.37 
 
 		 294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  37.37 
 
 		 294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  37.37 
 
 		 294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0477  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.54 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.840744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>