250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0394 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0394  transporter DMT superfamily protein  100 
 
 		 321 aa  613  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0466  transporter DMT superfamily protein  89.84 
 
 		 316 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0599  RarD protein, DMT superfamily transporter  56.36 
 
 		 302 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0535  transporter DMT superfamily protein  54.33 
 
 		 493 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.595832  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3201  RarD protein, DMT superfamily transporter  54.73 
 
 		 333 aa  282  5.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.510387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3092  transporter DMT superfamily protein  51.92 
 
 		 310 aa  278  8e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652908  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6667  RarD protein, DMT superfamily transporter  56.84 
 
 		 313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605512  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0297  RarD protein, DMT superfamily transporter  53.17 
 
 		 301 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2792  RarD protein, DMT superfamily transporter  51.79 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4403  RarD protein, DMT superfamily transporter  53.93 
 
 		 304 aa  258  7e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7674  RarD protein, DMT superfamily transporter  52.36 
 
 		 332 aa  255  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0604  RarD protein, DMT superfamily transporter  48.83 
 
 		 307 aa  255  7e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.452707  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0775  RarD protein, DMT superfamily transporter  56.29 
 
 		 305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5070  RarD protein, DMT superfamily transporter  47.24 
 
 		 351 aa  249  7e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3414  RarD protein, DMT superfamily transporter  51.23 
 
 		 312 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07630  rarD protein  53.47 
 
 		 314 aa  246  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0527752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2440  RarD protein, DMT superfamily transporter  49.46 
 
 		 311 aa  243  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.659696  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2699  RarD protein, DMT superfamily transporter  51.88 
 
 		 302 aa  241  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3544  RarD protein  45.14 
 
 		 304 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  44.37 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2679  RarD protein  47.3 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3395  RarD protein  45.3 
 
 		 301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96482  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.81 
 
 		 309 aa  232  5e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1661  transporter DMT superfamily protein  45.08 
 
 		 297 aa  232  7.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  46.05 
 
 		 302 aa  232  7.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21390  rarD protein  47.12 
 
 		 334 aa  231  9e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580416 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  39.67 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  41.37 
 
 		 313 aa  229  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0490  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.99 
 
 		 298 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.156296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  41.04 
 
 		 313 aa  229  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  40.72 
 
 		 313 aa  228  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0080  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.41 
 
 		 292 aa  227  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0477  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.75 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  39.87 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  39.87 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  39.87 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  39.87 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  39.87 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  39.74 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0891  transporter DMT superfamily protein  46.05 
 
 		 292 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  39.74 
 
 		 313 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  45.36 
 
 		 308 aa  223  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  41.43 
 
 		 295 aa  222  7e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2949  transporter DMT superfamily protein  48.39 
 
 		 295 aa  221  9e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1003  RarD protein, DMT superfamily transporter  50 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  38.97 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  42.66 
 
 		 335 aa  219  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0190  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.49 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  41.34 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1350  rarD protein  43.86 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.28 
 
 		 294 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0071  rarD protein  39.66 
 
 		 311 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  39.93 
 
 		 295 aa  215  9e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.24 
 
 		 295 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  40 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0570  hypothetical protein  45.49 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  40.69 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  40.93 
 
 		 294 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  39.93 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  40.93 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  41.28 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  41.28 
 
 		 294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  41.28 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1476  hypothetical protein  40.28 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  41.03 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2317  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.16 
 
 		 305 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000109763  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0588  hypothetical protein  41.92 
 
 		 298 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0009394  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  40.55 
 
 		 295 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3520  rarD protein  39.79 
 
 		 296 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194559 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06320  hypothetical protein  40.48 
 
 		 298 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257668  normal  0.652211 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.97 
 
 		 307 aa  209  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  39.58 
 
 		 296 aa  209  7e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  40.21 
 
 		 295 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23910  rarD protein  42.12 
 
 		 307 aa  208  9e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00670263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  39.31 
 
 		 297 aa  208  9e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.62 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  38.6 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  36.55 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0249  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.1 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0719  transporter DMT superfamily protein  37.54 
 
 		 313 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0332  rarD protein  41.2 
 
 		 293 aa  205  9e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2968  RarD protein  41.98 
 
 		 295 aa  205  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2967  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.36 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.895178 
 
 
-
 
NC_004310  BR0680  rarD protein  41.46 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.667831  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0655  RarD protein, DMT superfamily transporter  50 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.517971  normal  0.350174 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0334  transporter DMT superfamily protein  42.5 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0806  transporter DMT superfamily protein  41.44 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.86594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4844  transporter DMT superfamily protein  42.27 
 
 		 295 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000446481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  38.89 
 
 		 302 aa  202  8e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2608  transporter DMT superfamily protein  38.6 
 
 		 325 aa  201  9e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  36.33 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  37.19 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  37.37 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0621  transporter DMT superfamily protein  34.93 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000105334  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  36.01 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  36.84 
 
 		 296 aa  200  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  36.84 
 
 		 296 aa  200  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  36.84 
 
 		 296 aa  200  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  36.84 
 
 		 295 aa  200  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  36.84 
 
 		 296 aa  200  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>