243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0655 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0655  RarD protein, DMT superfamily transporter  100 
 
 		 336 aa  634    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.517971  normal  0.350174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0599  RarD protein, DMT superfamily transporter  52.56 
 
 		 302 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3092  transporter DMT superfamily protein  53.38 
 
 		 310 aa  263  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652908  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2792  RarD protein, DMT superfamily transporter  54.51 
 
 		 344 aa  259  6e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3414  RarD protein, DMT superfamily transporter  51.74 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3201  RarD protein, DMT superfamily transporter  49.84 
 
 		 333 aa  241  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.510387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0604  RarD protein, DMT superfamily transporter  50.67 
 
 		 307 aa  236  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.452707  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6667  RarD protein, DMT superfamily transporter  50 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605512  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21390  rarD protein  50.65 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580416 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0297  RarD protein, DMT superfamily transporter  49.47 
 
 		 301 aa  229  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07630  rarD protein  51.54 
 
 		 314 aa  227  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0527752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4403  RarD protein, DMT superfamily transporter  52.72 
 
 		 304 aa  226  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2699  RarD protein, DMT superfamily transporter  51.52 
 
 		 302 aa  220  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0535  transporter DMT superfamily protein  46.94 
 
 		 493 aa  219  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.595832  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1003  RarD protein, DMT superfamily transporter  49.83 
 
 		 319 aa  218  8.999999999999998e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7674  RarD protein, DMT superfamily transporter  48.49 
 
 		 332 aa  215  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2679  RarD protein  45.51 
 
 		 312 aa  209  7e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5070  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.21 
 
 		 351 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.04 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0466  transporter DMT superfamily protein  49.12 
 
 		 316 aa  202  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  39.68 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17690  rarD protein  45.7 
 
 		 336 aa  200  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0190  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.55 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0394  transporter DMT superfamily protein  49.66 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  42.41 
 
 		 294 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  40.41 
 
 		 295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  38.69 
 
 		 301 aa  196  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  42.03 
 
 		 298 aa  196  7e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  39 
 
 		 295 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  41.22 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  41.22 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  40.47 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  41.22 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  39.13 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.13 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  39.13 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  39.13 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  39.13 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  39.13 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  38.67 
 
 		 295 aa  192  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0775  RarD protein, DMT superfamily transporter  52.26 
 
 		 305 aa  192  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0239  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.39 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  41.5 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  38.82 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  38.1 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  40.27 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.34 
 
 		 307 aa  189  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  41.72 
 
 		 308 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.85 
 
 		 309 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0807  RarD protein, DMT superfamily transporter  48.57 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00187361  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0811  RarD protein, DMT superfamily transporter  48.57 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0657773  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0490  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.43 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.156296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  40.54 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06320  hypothetical protein  43.33 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257668  normal  0.652211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  40.41 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  40.74 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23910  rarD protein  38.87 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00670263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  40.74 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  39.19 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.59 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.69 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  40.74 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  38.8 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0588  hypothetical protein  42.33 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0009394  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  39.73 
 
 		 295 aa  186  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  42.05 
 
 		 303 aa  186  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0332  rarD protein  41.98 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  36.39 
 
 		 304 aa  186  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0477  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.58 
 
 		 298 aa  186  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  38.85 
 
 		 294 aa  186  7e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1247  transporter DMT superfamily protein  35.81 
 
 		 316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  0.0239516 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  39.73 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3395  RarD protein  41.14 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96482  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  38.91 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  37 
 
 		 304 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  38.78 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0080  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.93 
 
 		 292 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0760  hypothetical protein  47.86 
 
 		 301 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  37.18 
 
 		 309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0190  transporter DMT superfamily protein  40.4 
 
 		 295 aa  182  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.7183 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.04 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  39.04 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4619  transporter DMT superfamily protein  38.94 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  39.04 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  39.04 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  39.04 
 
 		 294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  39.86 
 
 		 295 aa  180  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  40.48 
 
 		 305 aa  180  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.34 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3544  RarD protein  43.3 
 
 		 304 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0249  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.6 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0829  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.91 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.412123  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1207  rarD protein  35.33 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  40 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  33.77 
 
 		 300 aa  177  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2440  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.78 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.659696  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2949  transporter DMT superfamily protein  45.14 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0891  transporter DMT superfamily protein  41.67 
 
 		 292 aa  176  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1952  rarD protein  42.36 
 
 		 307 aa  176  7e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  40 
 
 		 295 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>