248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0717 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0717  transporter DMT superfamily protein  100 
 
 		 294 aa  567  1e-161  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.424655  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  51.03 
 
 		 305 aa  301  8.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  52.05 
 
 		 294 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  52.05 
 
 		 294 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  51.71 
 
 		 295 aa  297  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  51.37 
 
 		 294 aa  295  8e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  50.88 
 
 		 298 aa  293  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  50.34 
 
 		 294 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  50.34 
 
 		 294 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  50.34 
 
 		 294 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  50.34 
 
 		 294 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  50 
 
 		 302 aa  289  4e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  51.71 
 
 		 295 aa  289  4e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  48.94 
 
 		 304 aa  288  9e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  50.71 
 
 		 298 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  50.71 
 
 		 295 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  50.71 
 
 		 295 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  50.71 
 
 		 295 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  50.71 
 
 		 294 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  49.49 
 
 		 309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  50.17 
 
 		 296 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  50.17 
 
 		 296 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  50.17 
 
 		 296 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  49.83 
 
 		 309 aa  286  4e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0190  transporter DMT superfamily protein  54.26 
 
 		 295 aa  286  4e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.7183 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  49.65 
 
 		 295 aa  285  7e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  49.66 
 
 		 294 aa  285  7e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  49.65 
 
 		 296 aa  285  9e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  49.65 
 
 		 296 aa  285  9e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  49.65 
 
 		 295 aa  285  9e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  49.65 
 
 		 296 aa  285  9e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  49.65 
 
 		 296 aa  285  9e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  49.65 
 
 		 296 aa  285  9e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  49.65 
 
 		 296 aa  285  9e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  51.03 
 
 		 302 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  50 
 
 		 298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  49.29 
 
 		 301 aa  281  6.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  50 
 
 		 305 aa  281  7.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  50.88 
 
 		 300 aa  280  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0332  rarD protein  51.76 
 
 		 293 aa  277  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  48.78 
 
 		 295 aa  277  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  47.74 
 
 		 300 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  50.53 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0190  RarD protein, DMT superfamily transporter  49.12 
 
 		 306 aa  269  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0239  RarD protein, DMT superfamily transporter  48.77 
 
 		 306 aa  264  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  46.04 
 
 		 307 aa  257  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  46.07 
 
 		 304 aa  256  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.32 
 
 		 307 aa  252  7e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  45.91 
 
 		 295 aa  249  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00198  Conserved membrane protein RarD  46.18 
 
 		 310 aa  246  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.493256  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  44.64 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  45.23 
 
 		 295 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.88 
 
 		 295 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  44.52 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  45.58 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  40.64 
 
 		 303 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06320  hypothetical protein  45.71 
 
 		 298 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257668  normal  0.652211 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  42.86 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0588  hypothetical protein  45.36 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0009394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  43.16 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  43.16 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  43.16 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  43.16 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4844  transporter DMT superfamily protein  43.82 
 
 		 295 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000446481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4698  RarD protein  44.48 
 
 		 295 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000777154  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0483  rarD protein  44.83 
 
 		 295 aa  225  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000325655  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  43.16 
 
 		 313 aa  225  6e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1952  rarD protein  42.66 
 
 		 307 aa  225  9e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  42.76 
 
 		 313 aa  223  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0806  transporter DMT superfamily protein  40.14 
 
 		 300 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.86594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  43.1 
 
 		 313 aa  223  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  42.76 
 
 		 313 aa  222  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  43.1 
 
 		 313 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  41.67 
 
 		 313 aa  222  6e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1350  rarD protein  40.64 
 
 		 300 aa  222  7e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  42.75 
 
 		 294 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0796  RarD protein  43.9 
 
 		 290 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000337641  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2608  transporter DMT superfamily protein  41.49 
 
 		 325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1661  transporter DMT superfamily protein  40 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1110  transporter DMT superfamily protein  45.15 
 
 		 313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  38.81 
 
 		 301 aa  215  8e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2719  transporter DMT superfamily protein  38.78 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2776  transporter DMT superfamily protein  38.78 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2967  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.32 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.895178 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2317  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.16 
 
 		 305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000109763  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4018  rarD protein  43.34 
 
 		 316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  37.32 
 
 		 309 aa  212  7e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0680  rarD protein  40.07 
 
 		 306 aa  212  7e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.667831  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0778  RarD protein  40.88 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0334  transporter DMT superfamily protein  42.46 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1859  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.61 
 
 		 310 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.898363  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05950  hypothetical protein, RarD family  44.88 
 
 		 298 aa  209  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  unclonable  0.0000000220659  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3677  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.6 
 
 		 320 aa  209  6e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0851  RarD protein  38.89 
 
 		 292 aa  209  6e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0193705  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1247  transporter DMT superfamily protein  40.34 
 
 		 316 aa  209  6e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  0.0239516 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0719  transporter DMT superfamily protein  37.2 
 
 		 313 aa  209  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3520  rarD protein  42.4 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194559 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0672  RarD protein  40.07 
 
 		 290 aa  206  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1336  permease  40.35 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0328749  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  38.03 
 
 		 308 aa  206  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>