288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0508 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0508  permease  100 
 
 		 294 aa  576  1.0000000000000001e-163  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.057497  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1118  rarD protein  53.24 
 
 		 295 aa  328  9e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1336  permease  39.38 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0328749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  38.87 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  38.87 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  38.87 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  38.87 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2776  transporter DMT superfamily protein  37.67 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2719  transporter DMT superfamily protein  37.67 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  38.87 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  38.87 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  38.87 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  38.52 
 
 		 313 aa  202  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  39.22 
 
 		 313 aa  202  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  38.52 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  35.03 
 
 		 301 aa  198  7e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  37.59 
 
 		 315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  37.97 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  37.97 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  37.97 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  37.97 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  37.97 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  37.97 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  37.97 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  38.1 
 
 		 298 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  38.31 
 
 		 295 aa  195  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  37.63 
 
 		 295 aa  195  9e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  38.31 
 
 		 295 aa  195  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  38.31 
 
 		 295 aa  195  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  37.76 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  36.86 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  36.86 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  36.86 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  38.44 
 
 		 298 aa  192  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  38.18 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  33.9 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  37.84 
 
 		 295 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0190  transporter DMT superfamily protein  37.54 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.7183 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  36.55 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  35.35 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0190  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.98 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  36.36 
 
 		 298 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  36.97 
 
 		 295 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.22 
 
 		 307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  37.14 
 
 		 294 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.86 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  37.01 
 
 		 294 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  38.25 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  37.14 
 
 		 294 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  37.01 
 
 		 294 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  37.01 
 
 		 294 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  37.01 
 
 		 294 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  36.65 
 
 		 294 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  35.14 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  36.86 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3092  transporter DMT superfamily protein  35.93 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652908  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  35.92 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  37.2 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0239  RarD protein, DMT superfamily transporter  37.54 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2317  RarD protein, DMT superfamily transporter  35.71 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000109763  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  37.71 
 
 		 297 aa  178  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  35.02 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0621  transporter DMT superfamily protein  35.86 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000105334  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  33.9 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  35.49 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0796  RarD protein  34.38 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000337641  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0717  transporter DMT superfamily protein  36.24 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.424655  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  36.15 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  34.68 
 
 		 295 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  36.62 
 
 		 300 aa  175  9e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  37.02 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0599  RarD protein, DMT superfamily transporter  34.34 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  35.02 
 
 		 295 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  35.34 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  34.16 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2425  RarD protein, DMT superfamily transporter  37.75 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0535  transporter DMT superfamily protein  34.58 
 
 		 493 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.595832  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0332  rarD protein  37.94 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  33.56 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0588  hypothetical protein  36.43 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0009394  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  34.52 
 
 		 294 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06320  hypothetical protein  36.43 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257668  normal  0.652211 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  32.54 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0936  rarD protein  34.88 
 
 		 295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0490  RarD protein, DMT superfamily transporter  34.56 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.156296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2440  RarD protein, DMT superfamily transporter  35.82 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.659696  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1859  RarD protein, DMT superfamily transporter  34.15 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.898363  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4080  transporter DMT superfamily protein  34.15 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0477  RarD protein, DMT superfamily transporter  33.89 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0795  RarD protein  32.54 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0595503  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0829  RarD protein, DMT superfamily transporter  32.54 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.412123  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0249  RarD protein, DMT superfamily transporter  35.02 
 
 		 298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  34.14 
 
 		 306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4844  transporter DMT superfamily protein  34.01 
 
 		 295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000446481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0778  RarD protein  32.86 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23910  rarD protein  33.67 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00670263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05950  hypothetical protein, RarD family  37.41 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  unclonable  0.0000000220659  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6667  RarD protein, DMT superfamily transporter  34.83 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605512  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0806  transporter DMT superfamily protein  32.27 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.86594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  31.4 
 
 		 335 aa  159  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>