299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_39760 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  548  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  64.66 
 
 
283 aa  322  5e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  65.65 
 
 
299 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  63.41 
 
 
297 aa  294  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22560  putative permease  66.55 
 
 
297 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000360321  hitchhiker  0.0000288178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4512  hypothetical protein  60.69 
 
 
296 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1399  hypothetical protein  60.34 
 
 
296 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.137527  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3801  hypothetical protein  60.34 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000662683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4018  hypothetical protein  60.75 
 
 
296 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  46.92 
 
 
309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.26 
 
 
317 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.16 
 
 
282 aa  149  6e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  30.69 
 
 
291 aa  126  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  28.83 
 
 
288 aa  123  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  30.31 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  28.57 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.23 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  29.9 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  28.57 
 
 
293 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  27.89 
 
 
293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  29.51 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  28.32 
 
 
298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.83 
 
 
296 aa  108  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296277  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  28.67 
 
 
294 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  28.67 
 
 
294 aa  105  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  28.32 
 
 
294 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  26.64 
 
 
292 aa  105  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  27.18 
 
 
297 aa  102  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  27.47 
 
 
292 aa  97.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  28.77 
 
 
293 aa  95.5  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0556  hypothetical protein  29.76 
 
 
296 aa  95.5  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4038  hypothetical protein  25.35 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2338  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.44 
 
 
293 aa  93.2  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0424523  normal  0.230999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.1 
 
 
289 aa  89  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000287238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.46 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00855  predicted permease  27.71 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  26.57 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0043  hypothetical protein  25.41 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.355426  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0190  hypothetical protein  29.37 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  22.57 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0218  hypothetical protein  29.37 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  26.22 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.49 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.53 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  23.58 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  22.41 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  21.99 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  21.99 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  21.58 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 
302 aa  67  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  27.48 
 
 
307 aa  65.5  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.66 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  29.51 
 
 
312 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588.2  DMT family permease  32.33 
 
 
145 aa  63.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  21.58 
 
 
302 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1231  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.38 
 
 
315 aa  63.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2955  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.19 
 
 
315 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.65096  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  21.58 
 
 
302 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  27.56 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.76 
 
 
310 aa  63.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  27.05 
 
 
307 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  28.52 
 
 
302 aa  62.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 
298 aa  63.2  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  23.08 
 
 
307 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.22 
 
 
312 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  32.11 
 
 
294 aa  62.4  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  23.34 
 
 
296 aa  62.4  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  29.86 
 
 
317 aa  62  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  28.88 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2916  DMT family permease  27.01 
 
 
297 aa  60.1  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.3 
 
 
313 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  25.87 
 
 
301 aa  59.3  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  33.94 
 
 
327 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  26.85 
 
 
292 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.98 
 
 
299 aa  59.3  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  30.16 
 
 
308 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.94 
 
 
282 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  33.16 
 
 
301 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.16 
 
 
301 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  27.49 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  33.16 
 
 
301 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  33.16 
 
 
301 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.94 
 
 
282 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  33.16 
 
 
301 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  32.69 
 
 
297 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.39 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  34.17 
 
 
304 aa  58.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  26.46 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  33.16 
 
 
301 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  33.16 
 
 
301 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1249  hypothetical protein  33.65 
 
 
313 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.36 
 
 
297 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  32.65 
 
 
301 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  28.96 
 
 
288 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  25.27 
 
 
298 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  25.25 
 
 
315 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2930  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.1 
 
 
316 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  25.27 
 
 
298 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0865968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>