56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2955 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2955  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 315 aa  624  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.65096  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00855  predicted permease  40.47 
 
 		 309 aa  219  6e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0043  hypothetical protein  37.85 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.355426  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.02 
 
 		 296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2338  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.37 
 
 		 293 aa  142  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0424523  normal  0.230999 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4038  hypothetical protein  29.63 
 
 		 287 aa  142  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1231  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.55 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000287238 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0190  hypothetical protein  31.51 
 
 		 304 aa  116  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0218  hypothetical protein  31.51 
 
 		 320 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.29 
 
 		 301 aa  115  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04828  integral membrane protein DUF6  31.14 
 
 		 307 aa  104  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  26.01 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  26.37 
 
 		 293 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.15 
 
 		 282 aa  92  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  26.96 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  27.39 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  25.58 
 
 		 292 aa  90.9  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  26.07 
 
 		 290 aa  90.1  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.66 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.18 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  24.91 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  32.6 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  29.12 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  29.71 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  24.75 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  25.42 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  25.42 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  28.87 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  26.69 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  25.83 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  27.3 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  24.61 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4512  hypothetical protein  28.62 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1399  hypothetical protein  29.29 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.137527  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22560  putative permease  30.13 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000360321  hitchhiker  0.0000288178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3801  hypothetical protein  29.39 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000662683 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0556  hypothetical protein  25.4 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  22.71 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588.2  DMT family permease  26.62 
 
 		 145 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4018  hypothetical protein  28.28 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321075 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  24.86 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  21.62 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4191  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.61 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.168223  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.43 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  20.8 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.61 
 
 		 302 aa  46.6  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  29.14 
 
 		 309 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  29.14 
 
 		 309 aa  45.8  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  24.87 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  33.33 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  21.01 
 
 		 282 aa  43.9  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  33.33 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.58 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.99 
 
 		 302 aa  42.7  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>