101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1231 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1231  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 315 aa  607  1e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0218  hypothetical protein  68.11 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0190  hypothetical protein  68.11 
 
 		 304 aa  365  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04828  integral membrane protein DUF6  79.68 
 
 		 307 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4038  hypothetical protein  31.96 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2338  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.65 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0424523  normal  0.230999 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00855  predicted permease  34.21 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.53 
 
 		 289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000287238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.96 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0043  hypothetical protein  30.43 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.355426  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2955  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.37 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.65096  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  30.56 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  31.33 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  31 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  31.97 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  30.97 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  28.04 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31 
 
 		 293 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  31 
 
 		 293 aa  99.8  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  28.76 
 
 		 297 aa  100  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  31 
 
 		 293 aa  99.4  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  31.5 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  31.07 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0556  hypothetical protein  30.5 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  29.83 
 
 		 291 aa  90.9  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  28.98 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.19 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  31.39 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  31.86 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  30.94 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  30.38 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  31.23 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588.2  DMT family permease  32.87 
 
 		 145 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  26.78 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.51 
 
 		 317 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22560  putative permease  29.84 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000360321  hitchhiker  0.0000288178 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  24.15 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  28.11 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.26 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  26.76 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1360  hypothetical protein  35 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170247  hitchhiker  0.00808749 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  27.39 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.42 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  27.04 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  28.57 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.18 
 
 		 318 aa  52.8  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  27.62 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0919  hypothetical protein  27.21 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.68 
 
 		 325 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  26.24 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  23.95 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  23.95 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  23.62 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  23.62 
 
 		 303 aa  49.7  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3092  transporter DMT superfamily protein  26.43 
 
 		 310 aa  49.3  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652908  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  23.62 
 
 		 303 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  28.17 
 
 		 290 aa  49.3  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  23.3 
 
 		 303 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  23.3 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  24.81 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1239  hypothetical protein  23.81 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000937843  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  25 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19920  predicted permease, DMT superfamily  25.74 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.185467  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  24.38 
 
 		 304 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.31 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  29.47 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  24.64 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3336  hypothetical protein  31.25 
 
 		 325 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.547457  normal  0.396992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  30.28 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  24.28 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  27.55 
 
 		 309 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 		 302 aa  46.2  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.69 
 
 		 323 aa  45.8  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  24 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3621  hypothetical protein  31.66 
 
 		 319 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  27.36 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.69 
 
 		 317 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  23.67 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.13 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  26.09 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  23.11 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.14 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.2 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  25.56 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  26.53 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.1 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  35.14 
 
 		 278 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.97 
 
 		 283 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3217  hypothetical protein  37.7 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00240946  normal  0.367781 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  25.65 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  25.51 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  21.46 
 
 		 313 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7072  hypothetical protein  25.18 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.25 
 
 		 310 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2461  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.23 
 
 		 347 aa  43.1  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.508316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.98 
 
 		 298 aa  42.7  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1399  hypothetical protein  28.24 
 
 		 296 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.137527  normal  0.630416 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>