197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0279 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  589  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0216  protein of unknown function DUF6 transmembrane  73.43 
 
 		 301 aa  328  5.0000000000000004e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0201  hypothetical protein  73.43 
 
 		 301 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0331  hypothetical protein  47.9 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  43.75 
 
 		 299 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3308  drug/metabolite exporter (DME) family protein  41.75 
 
 		 307 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4041  hypothetical protein  41.75 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3934  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.51 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0858224  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.96 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0042e-23 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.43 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00529542  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0189  hypothetical protein  41.73 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.41043  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  32.22 
 
 		 347 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0305  hypothetical protein  44.5 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1897  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.31 
 
 		 319 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.454728 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  31.14 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  32.51 
 
 		 321 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  39.53 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.52 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22564 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1701  hypothetical protein  38.41 
 
 		 330 aa  85.9  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0475  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.58 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2155  hypothetical protein  31.16 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00200  predicted permease, DMT superfamily  34.63 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.25 
 
 		 325 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.01 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  31.47 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0769  hypothetical protein  33.94 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.59 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2269  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.49 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  25.09 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  25.67 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3305  catalase  38.06 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.371892 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  23.97 
 
 		 296 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.02 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.74 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1861  hypothetical protein  32.43 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.654734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  28.09 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  32.74 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  27.99 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  21.67 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  26.76 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.37 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  31.72 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  31.72 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  31.72 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  25.84 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0463  hypothetical protein  20.49 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  26.44 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27900  membrane protein  31.47 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0399576 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  28.34 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  29.33 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  27.83 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  24.65 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  31.31 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.62 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3662  hypothetical protein  31.21 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  29.67 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  24.31 
 
 		 274 aa  54.3  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  27.54 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  31.1 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  24.58 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  28.67 
 
 		 306 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  30.63 
 
 		 281 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  30.18 
 
 		 325 aa  53.1  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 		 292 aa  53.1  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  28.67 
 
 		 306 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.84 
 
 		 298 aa  52.8  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  26.39 
 
 		 293 aa  52.8  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  27.24 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.17 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.61 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  32.07 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.49 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  27.24 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  23.42 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  28.62 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  36.67 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.43 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  36.67 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  25.17 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  26.9 
 
 		 308 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  25.5 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  32.31 
 
 		 278 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  24.81 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0882  hypothetical protein  23 
 
 		 296 aa  50.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000008536  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2593  hypothetical protein  30.38 
 
 		 316 aa  50.1  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.07 
 
 		 287 aa  49.7  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  24.24 
 
 		 302 aa  49.3  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  25.44 
 
 		 307 aa  49.3  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.81 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  41.56 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  37.89 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  26.71 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.76 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  41.56 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  41.56 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  41.56 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  41.56 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  27.74 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>