291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_22560 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_22560  putative permease  100 
 
 		 297 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000360321  hitchhiker  0.0000288178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  91.38 
 
 		 299 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  72.63 
 
 		 297 aa  350  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3801  hypothetical protein  73.54 
 
 		 296 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000662683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4512  hypothetical protein  73.13 
 
 		 296 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1399  hypothetical protein  72.79 
 
 		 296 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.137527  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  64.91 
 
 		 283 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  66.55 
 
 		 290 aa  304  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4018  hypothetical protein  73.81 
 
 		 296 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  52.71 
 
 		 309 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.1 
 
 		 317 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.14 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  33.46 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  31.11 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  31.25 
 
 		 293 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  31.25 
 
 		 293 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  31.25 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.9 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  32.1 
 
 		 294 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  34.04 
 
 		 293 aa  126  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  27.93 
 
 		 292 aa  123  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  31.49 
 
 		 294 aa  123  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  30.53 
 
 		 298 aa  118  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  30.48 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  31.6 
 
 		 294 aa  116  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  31.6 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4038  hypothetical protein  30.66 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  30.34 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0556  hypothetical protein  33.57 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  29.59 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  28.89 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2338  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.31 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0424523  normal  0.230999 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00855  predicted permease  29.19 
 
 		 309 aa  93.2  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000287238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.42 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  31.01 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1231  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.68 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  29.37 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.29 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0190  hypothetical protein  30.86 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0218  hypothetical protein  31 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  28.93 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  24 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.85 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  31.69 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0043  hypothetical protein  24.13 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.355426  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  26.82 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  32.86 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588.2  DMT family permease  35.29 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  31.16 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  23.13 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  22.81 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.19 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.21 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  24.79 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.11 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  30 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  22.92 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.42 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  24.79 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2955  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.77 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.65096  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  24.79 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  25.61 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  27.82 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  29.26 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  30.32 
 
 		 292 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  29.26 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  23.13 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  29.49 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  31.34 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  24.79 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  30.38 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  21.84 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.23 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  29.7 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  22.31 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1531  hypothetical protein  28.06 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0755616 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  23.08 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04860  membrane protein  29.32 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  27.96 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  30.99 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  28.65 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  28.09 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  33.33 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  27.73 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  22.31 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  23.58 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  23.58 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  23.58 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2916  DMT family permease  28.25 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.97 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  24.78 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  28.74 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.97 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.138345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  29.77 
 
 		 219 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2138  hypothetical protein  28.57 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00025642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>