278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0078 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 301 aa  578  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.138345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  74.38 
 
 		 290 aa  395  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  74.32 
 
 		 317 aa  396  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  69.96 
 
 		 299 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.98 
 
 		 293 aa  261  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 		 310 aa  99  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  28.97 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  30.92 
 
 		 294 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.33 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  29.63 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  28.92 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.53 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  30.21 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.77 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.36 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  36.11 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  29.68 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.94 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  26.17 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  27.33 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  25.61 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0438  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.22 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  24.39 
 
 		 311 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  26.5 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  26.4 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  26.4 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  25.99 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  25 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.96 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  27.56 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.71 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  29.26 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0742  hypothetical protein  27.13 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  27.09 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  28.21 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  26.2 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.33 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  25.33 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  30.81 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.56 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  23.58 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  23.51 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  24.11 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  23.51 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0320  hypothetical protein  26.67 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4022  hypothetical protein  29.74 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  24.2 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  24 
 
 		 274 aa  57  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  25.55 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.59 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.37 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  26.69 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  24.84 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.96 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.82 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  25.72 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  23.27 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4191  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.74 
 
 		 298 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.168223  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.45 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46700  hypothetical protein  29.31 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.022597  decreased coverage  0.000000235263 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  23.36 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  25.74 
 
 		 292 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  28 
 
 		 308 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.56 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.04 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0189  hypothetical protein  24.47 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3095  integral membrane protein  26.59 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194858  normal  0.101185 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  26.33 
 
 		 296 aa  53.9  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  23.05 
 
 		 293 aa  53.9  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  22.81 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  25.81 
 
 		 351 aa  53.5  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  24.43 
 
 		 300 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  27.85 
 
 		 289 aa  53.1  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  23.81 
 
 		 293 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  23.81 
 
 		 293 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  28.93 
 
 		 310 aa  53.1  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  25.17 
 
 		 304 aa  52.8  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  23.39 
 
 		 293 aa  53.1  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  27.38 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  23.97 
 
 		 300 aa  52.8  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.79 
 
 		 299 aa  52.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.426816 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.44 
 
 		 313 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  23.27 
 
 		 322 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0979  DMT family permease  22.52 
 
 		 299 aa  52.4  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.974492  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27900  membrane protein  28 
 
 		 311 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0399576 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  24.66 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1515  hypothetical protein  25.99 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.910638  normal  0.799854 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0068  hypothetical protein  25.98 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  23.56 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0305  hypothetical protein  29.39 
 
 		 349 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  25.1 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  26.84 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  26.58 
 
 		 310 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.91 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.65 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>