More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0907 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  599  1e-170  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  40.94 
 
 		 327 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.34 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.34 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  38.31 
 
 		 281 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4912  membrane protein  33.81 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  28.52 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2581  hypothetical protein  27.91 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0869086  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0464  membrane protein  33.71 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0809  hypothetical protein  26.6 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  27.82 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.1 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.815288  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  24.11 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.57 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.23 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  29.61 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.78 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1060  hypothetical protein  28.78 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  28.81 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  27.31 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  27.4 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  28.28 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.87 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  25.22 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  29.11 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  26.54 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  27.48 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.15 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  26.05 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  25.09 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.99 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  26.05 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1259  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.83 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.33673 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  25.9 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.3 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2506  hypothetical protein  28.67 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2687  hypothetical protein  27.37 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.42391  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  26.03 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  25.47 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  27.84 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  28.44 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  32.11 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  27.5 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.48 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  27.27 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1705  hypothetical protein  31.98 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  29 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  27.27 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  26.13 
 
 		 219 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  23.88 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  27.27 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0754  hypothetical protein  22.17 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000572396  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  26.05 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.14 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  26.05 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  26.05 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  26.52 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1917  hypothetical protein  25.42 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.99 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  25.94 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  25.63 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  25.74 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  28.32 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  27.84 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.83 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  29.35 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  24.91 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  29.06 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  28.57 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  25.38 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  28.57 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  29.55 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  31.12 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.76 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0556  hypothetical protein  28.17 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  28.1 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  23.27 
 
 		 322 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  28.86 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.32 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3095  integral membrane protein  24.39 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194858  normal  0.101185 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1038  hypothetical protein  28.36 
 
 		 273 aa  54.3  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000348344  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04860  membrane protein  26.15 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.26 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  27.19 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  25.1 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  53.9  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.55 
 
 		 310 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  24.57 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  24.26 
 
 		 302 aa  53.5  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  26.76 
 
 		 300 aa  53.1  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  29.53 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  24.59 
 
 		 302 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19920  predicted permease, DMT superfamily  24.3 
 
 		 331 aa  53.1  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.185467  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  23.24 
 
 		 298 aa  52.8  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.5 
 
 		 299 aa  52.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>