59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1060 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1060  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  573  1.0000000000000001e-163  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2581  hypothetical protein  46.15 
 
 		 295 aa  199  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0869086  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0809  hypothetical protein  37.54 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.36 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.815288  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1259  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.88 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.33673 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0340  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.88 
 
 		 285 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.129691  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4912  membrane protein  29.76 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.01 
 
 		 301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0464  membrane protein  32.53 
 
 		 293 aa  105  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2506  hypothetical protein  29.63 
 
 		 337 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1917  hypothetical protein  35.4 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2032  hypothetical protein  26.99 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0029442  normal  0.0470657 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  30.04 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2138  hypothetical protein  30.97 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00025642  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2687  hypothetical protein  31.67 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.42391  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  30.58 
 
 		 307 aa  86.7  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1705  hypothetical protein  32.82 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0754  hypothetical protein  24.41 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000572396  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2745  hypothetical protein  30.71 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.097  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2430  hypothetical protein  29.48 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2752  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.29 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.23 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1251  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0738172  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2557  hypothetical protein  29.41 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209114  hitchhiker  0.00319477 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  26.98 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  29.61 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  27.27 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.67 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.67 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  25.71 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.44 
 
 		 325 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  26.88 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1531  hypothetical protein  23.75 
 
 		 267 aa  50.4  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0755616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  25.68 
 
 		 292 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  28.65 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  29.08 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  25 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  26.14 
 
 		 292 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  23.21 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.25 
 
 		 359 aa  47  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.902863 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  27.84 
 
 		 299 aa  46.6  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  23.21 
 
 		 304 aa  45.8  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  27.97 
 
 		 297 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.11 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  29.89 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  26.25 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.47 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0416  hypothetical protein  26.49 
 
 		 345 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04860  membrane protein  25.11 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  36.36 
 
 		 333 aa  43.5  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  32.03 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.33 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.36 
 
 		 315 aa  43.1  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  33.03 
 
 		 297 aa  42.7  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  26.67 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  35.9 
 
 		 315 aa  42.4  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>