26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0464 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0464  membrane protein  100 
 
 
293 aa  550  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4912  membrane protein  30.11 
 
 
298 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1060  hypothetical protein  32.53 
 
 
301 aa  107  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2581  hypothetical protein  33.45 
 
 
295 aa  102  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0869086  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1259  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.15 
 
 
295 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.33673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.79 
 
 
293 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.815288  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0809  hypothetical protein  30.85 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2032  hypothetical protein  26.28 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0029442  normal  0.0470657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  33.71 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0340  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.5 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.129691  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2506  hypothetical protein  30.26 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.16 
 
 
301 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.8 
 
 
301 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1705  hypothetical protein  31.9 
 
 
305 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  25.8 
 
 
327 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.8 
 
 
282 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  31.03 
 
 
281 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2687  hypothetical protein  29.47 
 
 
295 aa  55.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.42391  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.44 
 
 
282 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0754  hypothetical protein  22.14 
 
 
284 aa  52  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000572396  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2138  hypothetical protein  29.7 
 
 
280 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00025642  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1917  hypothetical protein  30.77 
 
 
297 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2745  hypothetical protein  30.99 
 
 
291 aa  50.1  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.097  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0056  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.12 
 
 
304 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.76 
 
 
287 aa  42.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  27.62 
 
 
291 aa  42.4  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>