54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1917 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1917  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  566  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  59.6 
 
 		 291 aa  332  5e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2752  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.14 
 
 		 309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2745  hypothetical protein  60.07 
 
 		 291 aa  310  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.097  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2138  hypothetical protein  57.84 
 
 		 280 aa  297  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00025642  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2430  hypothetical protein  59.12 
 
 		 291 aa  291  7e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1705  hypothetical protein  59.44 
 
 		 305 aa  291  9e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1251  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.66 
 
 		 294 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0738172  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2557  hypothetical protein  59.32 
 
 		 294 aa  255  7e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209114  hitchhiker  0.00319477 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1060  hypothetical protein  35.4 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2581  hypothetical protein  33.83 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0869086  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.8 
 
 		 301 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.81 
 
 		 301 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2506  hypothetical protein  28.21 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0340  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.77 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.129691  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4912  membrane protein  27.34 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  31.79 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2687  hypothetical protein  29.33 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.42391  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.6 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.6 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  32.23 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  25.68 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2032  hypothetical protein  25.09 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0029442  normal  0.0470657 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.03 
 
 		 296 aa  52.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  25.5 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.59 
 
 		 293 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.815288  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  30.28 
 
 		 285 aa  49.7  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0464  membrane protein  30.77 
 
 		 293 aa  49.3  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1259  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.97 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.33673 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  27.21 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.22 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  25.34 
 
 		 219 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  28.89 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  24.56 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0453  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.82 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000315888  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.43 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.22 
 
 		 306 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0267  hypothetical protein  24.53 
 
 		 306 aa  46.2  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0809  hypothetical protein  27.65 
 
 		 300 aa  46.2  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  23.99 
 
 		 292 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  25 
 
 		 306 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  26.47 
 
 		 312 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  25 
 
 		 306 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0922  hypothetical protein  29.53 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0900  hypothetical protein  29.47 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  25.75 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  29.23 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  32.76 
 
 		 283 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  23.65 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.08 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.01 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  25.19 
 
 		 293 aa  43.5  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  26.19 
 
 		 288 aa  43.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  28.22 
 
 		 298 aa  42.7  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>