48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2430 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2430  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  562  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  82.47 
 
 		 291 aa  479  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2752  protein of unknown function DUF6 transmembrane  71.09 
 
 		 309 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2138  hypothetical protein  72.5 
 
 		 280 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00025642  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2745  hypothetical protein  68.86 
 
 		 291 aa  368  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.097  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1251  protein of unknown function DUF6 transmembrane  69.23 
 
 		 294 aa  317  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0738172  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1917  hypothetical protein  59.12 
 
 		 297 aa  315  5e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2557  hypothetical protein  68.53 
 
 		 294 aa  310  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209114  hitchhiker  0.00319477 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1705  hypothetical protein  60.5 
 
 		 305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1060  hypothetical protein  29.1 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2506  hypothetical protein  28.26 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2581  hypothetical protein  26.77 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0869086  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.03 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0340  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.61 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.129691  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2687  hypothetical protein  27.08 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.42391  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  25.43 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4912  membrane protein  24.9 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  30.48 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.25 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.08 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.08 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  21.65 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.37 
 
 		 300 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.3 
 
 		 297 aa  49.3  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.82 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  27.96 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  29.25 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0809  hypothetical protein  25.47 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.8 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.815288  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  25.4 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  29.32 
 
 		 327 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04860  membrane protein  27.19 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  21.92 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.25 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3801  hypothetical protein  32.77 
 
 		 296 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000662683 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0936  rarD protein  28.19 
 
 		 295 aa  46.2  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  28.64 
 
 		 283 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22560  putative permease  42.11 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000360321  hitchhiker  0.0000288178 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.13 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4018  hypothetical protein  33.05 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321075 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  27.46 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1399  hypothetical protein  33.61 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.137527  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  28.43 
 
 		 312 aa  42.7  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  37.5 
 
 		 291 aa  42.7  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4512  hypothetical protein  33.61 
 
 		 296 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  29.55 
 
 		 305 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>