217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4512 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4512  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1399  hypothetical protein  98.99 
 
 		 296 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.137527  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4018  hypothetical protein  95.27 
 
 		 296 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321075 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3801  hypothetical protein  89.49 
 
 		 296 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000662683 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  78.2 
 
 		 297 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  70.71 
 
 		 299 aa  347  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22560  putative permease  72.88 
 
 		 297 aa  325  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000360321  hitchhiker  0.0000288178 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  60.63 
 
 		 283 aa  298  5e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  61.03 
 
 		 290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  49.64 
 
 		 309 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.07 
 
 		 317 aa  231  9e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.31 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  30.66 
 
 		 288 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  32.49 
 
 		 291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  29.89 
 
 		 294 aa  125  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  29.54 
 
 		 293 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  29.54 
 
 		 293 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  29.54 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.18 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  30.39 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  29.89 
 
 		 294 aa  116  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  27.66 
 
 		 290 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  31.16 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  27.44 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  30.25 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  26.17 
 
 		 292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  30.25 
 
 		 294 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  28.32 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  28.09 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0556  hypothetical protein  29.07 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  30.07 
 
 		 305 aa  85.9  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.86 
 
 		 296 aa  85.5  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.25 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2338  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.58 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0424523  normal  0.230999 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4038  hypothetical protein  26.12 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.93 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  29.18 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  30.27 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00855  predicted permease  28.09 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  30.88 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  25.9 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  29.43 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.25 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  24.81 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  22.59 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  29.68 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  24.9 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.9 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  27.14 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.81 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0043  hypothetical protein  25.99 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.355426  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  27.24 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  24.12 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.77 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  29.59 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  25.1 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  25.09 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.77 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  25.82 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  25.82 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.2 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.16 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000287238 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588.2  DMT family permease  35.38 
 
 		 145 aa  65.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  30.04 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  29.55 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  27.33 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2955  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.65096  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  32.55 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.82 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.86 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1231  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.71 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.09 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  25.54 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.64 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  28.2 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0189  hypothetical protein  26.37 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0218  hypothetical protein  28.73 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  27.18 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  26.63 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.37 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0190  hypothetical protein  28.73 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  28 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  28.63 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  25.17 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  29.9 
 
 		 512 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  24.41 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  27.67 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  26.18 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3095  integral membrane protein  25.72 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194858  normal  0.101185 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.44 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  28.76 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 317 aa  54.3  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.23 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  29.9 
 
 		 343 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  29.9 
 
 		 343 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  26.77 
 
 		 359 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6312  hypothetical protein  28.69 
 
 		 300 aa  53.1  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.15 
 
 		 317 aa  53.1  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  30.84 
 
 		 219 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>