More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2268 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 302 aa  589  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  93.96 
 
 		 298 aa  521  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  66.45 
 
 		 302 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  52.92 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  48.72 
 
 		 308 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.45 
 
 		 300 aa  236  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  43.16 
 
 		 294 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  43.51 
 
 		 294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  43.51 
 
 		 294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  43.16 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  43.16 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  42.81 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.17 
 
 		 295 aa  211  9e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.24 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  42.2 
 
 		 296 aa  206  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  43.16 
 
 		 295 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  43.16 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  38.94 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.51 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.918526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.54 
 
 		 305 aa  185  7e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  37.73 
 
 		 297 aa  185  7e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  36.73 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  37.73 
 
 		 300 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.62 
 
 		 302 aa  172  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2028  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.74 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0587  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.44 
 
 		 300 aa  165  8e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.770016  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  35.09 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  33.45 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  32.74 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  32.74 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  33.09 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  32.74 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  33.09 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  33.09 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1219  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.16 
 
 		 288 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  33.09 
 
 		 303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  32.74 
 
 		 303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  33.45 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  35.71 
 
 		 286 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2109  hypothetical protein  36.11 
 
 		 295 aa  149  8e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.33 
 
 		 307 aa  148  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0748  hypothetical protein  37.46 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  40 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.82 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841785  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0063  hypothetical protein  38.16 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3455  hypothetical protein  34.97 
 
 		 300 aa  126  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1257  hypothetical protein  43.64 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1136  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.57 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  31.38 
 
 		 296 aa  118  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2519  hypothetical protein  38.06 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.561835 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.31 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557636 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.53 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.44 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7770  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.8 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.11 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1038  hypothetical protein  34.4 
 
 		 273 aa  109  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000348344  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.87 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1137  hypothetical protein  33.78 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.893174  hitchhiker  0.00000000116999 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0089  hypothetical protein  37.04 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.893408  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.03 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.52 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0097  hypothetical protein  34.92 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  32.01 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 290 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  29.89 
 
 		 283 aa  96.7  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1219  hypothetical protein  34.62 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.465362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.34 
 
 		 325 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0721  hypothetical protein  35.11 
 
 		 306 aa  89.7  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.73 
 
 		 284 aa  89.4  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  30.04 
 
 		 281 aa  87.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0861  hypothetical protein  22.91 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2973  hypothetical protein  28.14 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  30.24 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  30.24 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.19 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0010  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.1 
 
 		 312 aa  75.5  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000132585 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0667  hypothetical protein  35.57 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.522504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.09 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  29.46 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  29.86 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00855  predicted permease  25.17 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  27.46 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0009  hypothetical protein  31.05 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.87 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  28.99 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  30.09 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  27.27 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46762  predicted protein  25.65 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.013384  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1531  hypothetical protein  27.01 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0755616 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  27.27 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  26.04 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  23.12 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2581  hypothetical protein  26.74 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0869086  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  30.4 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  24.92 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  23.12 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  25.86 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.17 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>