298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2651 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  97.32 
 
 		 298 aa  527  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  96.98 
 
 		 298 aa  527  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  82.94 
 
 		 301 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  74.04 
 
 		 292 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  72.63 
 
 		 292 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  57.71 
 
 		 305 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  70.09 
 
 		 219 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0453  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.33 
 
 		 288 aa  216  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000315888  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2916  DMT family permease  45.59 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1509  hypothetical protein  83.82 
 
 		 82 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.585476  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  29.14 
 
 		 287 aa  95.5  9e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  29.41 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  28.03 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  28.11 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  28.57 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  28.57 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  28.33 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  28.23 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  27.41 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.28 
 
 		 329 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  27.34 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  28.21 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  29 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  25.59 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.03 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  27.03 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.7 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.32 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.902863 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  25.95 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  26.94 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  30.34 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.67 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  27.21 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  27.21 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  25.81 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  28.08 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.9 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  24.91 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.83 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  27.44 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.35 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  29.24 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  29.41 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  26.1 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.36 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.5 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.8 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  24.48 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  31.6 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  31.13 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01032  Transporter involved in threonine and homoserine efflux  26.69 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.614417  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  30.19 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  26.51 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2396  hypothetical protein  70.45 
 
 		 49 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  29.23 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.42 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.01 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  23.31 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.01 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.26 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  24.83 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  25.65 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.39 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  26.41 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3095  integral membrane protein  25.09 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194858  normal  0.101185 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.9 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  23.71 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  25.54 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  26.95 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  25.47 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  28.03 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  26.62 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  29.64 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  28.28 
 
 		 307 aa  57  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  24.67 
 
 		 310 aa  57  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  29.64 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 		 301 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  28.17 
 
 		 304 aa  57  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  25.09 
 
 		 343 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  31.53 
 
 		 397 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  28.21 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  29.87 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  25.44 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  24.48 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  23.26 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  23.26 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  26.12 
 
 		 512 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  27.24 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  24.29 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  25.77 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1395  hypothetical protein  29.79 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  24.83 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  26.74 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  22.92 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  23.05 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  26.67 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>