More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1923 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 298 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  91.95 
 
 		 298 aa  527  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  38.72 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.79 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  39.58 
 
 		 308 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  37.72 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.16 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  37.77 
 
 		 397 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  37.5 
 
 		 309 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  38.21 
 
 		 312 aa  145  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  40.88 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  38.63 
 
 		 309 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  38.63 
 
 		 309 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  39.35 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  38.99 
 
 		 309 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  29.62 
 
 		 296 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  36.09 
 
 		 402 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  29.62 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  30.37 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.11 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.46 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  37.01 
 
 		 356 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  37.01 
 
 		 356 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  37.01 
 
 		 356 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  37.01 
 
 		 356 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  36.65 
 
 		 353 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  36.65 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  36.65 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  27.27 
 
 		 288 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  31.25 
 
 		 316 aa  115  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.25 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5553  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.21 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  35.79 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  32.32 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  35.93 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  27.24 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  27.24 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  29.64 
 
 		 281 aa  90.5  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  28.57 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.86 
 
 		 313 aa  86.3  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  32.16 
 
 		 294 aa  86.3  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.85 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.9 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  26.6 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  33.09 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0562  hypothetical protein  28.67 
 
 		 328 aa  79  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.368396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.72 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  25.1 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  27.3 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  26.43 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  24.69 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  25.51 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  31.96 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  23.27 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  30.81 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  25.96 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  25.9 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  24.7 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  22.93 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  24.46 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  23.89 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2506  hypothetical protein  28.57 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  25.71 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  23.48 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  22.86 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  22.86 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  23.48 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  22.18 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.9 
 
 		 315 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.61 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  23.48 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  23.48 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.16 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  27.64 
 
 		 532 aa  66.6  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  29.88 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.14 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.19 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  29.31 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.57 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0196  hypothetical protein  25.75 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.92 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.84 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  29.95 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  26.29 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3877  hypothetical protein  27.18 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  31.44 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  27.27 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  28.06 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  27.34 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.04 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.896113  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  24.48 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2881  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.7 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.34 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  0.15573 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  24.59 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1849  hypothetical protein  26.89 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  27.13 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1515  hypothetical protein  28.47 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.910638  normal  0.799854 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.61 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>