174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0539 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  100 
 
 
512 aa  1010    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  99.13 
 
 
343 aa  670    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  98.83 
 
 
343 aa  668    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  93.44 
 
 
306 aa  534  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  79.73 
 
 
300 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  79.05 
 
 
300 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  79.39 
 
 
300 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  77.26 
 
 
301 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  76.71 
 
 
299 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6312  hypothetical protein  81.08 
 
 
300 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3010  hypothetical protein  79.93 
 
 
300 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0435  protein of unknown function DUF6 transmembrane  75.08 
 
 
299 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2873  hypothetical protein  79.93 
 
 
300 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  58.36 
 
 
298 aa  323  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  56.94 
 
 
302 aa  313  5.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  60.98 
 
 
304 aa  308  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.8 
 
 
313 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.8 
 
 
300 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  55.79 
 
 
298 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  54.21 
 
 
307 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  54.21 
 
 
307 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  54.11 
 
 
318 aa  294  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.44 
 
 
300 aa  279  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22136  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.64 
 
 
300 aa  279  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  56.34 
 
 
299 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2040  hypothetical protein  56.89 
 
 
308 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.136673  normal  0.653396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  54.98 
 
 
298 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  55.56 
 
 
304 aa  259  7e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.8 
 
 
329 aa  256  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  59.13 
 
 
255 aa  256  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2640  hypothetical protein  55.63 
 
 
299 aa  243  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0416  hypothetical protein  39.39 
 
 
312 aa  219  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3724  hypothetical protein  53.58 
 
 
272 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  42.21 
 
 
307 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0189  hypothetical protein  44.95 
 
 
295 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.36 
 
 
306 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  40.33 
 
 
306 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  28.1 
 
 
311 aa  133  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  30.8 
 
 
307 aa  127  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  30.66 
 
 
302 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  30.66 
 
 
302 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.97 
 
 
312 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.68 
 
 
313 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  30.29 
 
 
300 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  30.29 
 
 
300 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  30.29 
 
 
300 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  31 
 
 
289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  30.29 
 
 
302 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.01 
 
 
307 aa  117  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  29.56 
 
 
281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  32.23 
 
 
293 aa  110  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3334  hypothetical protein  37.63 
 
 
315 aa  109  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  32.23 
 
 
316 aa  106  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.71 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  29.45 
 
 
287 aa  82.8  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  27.02 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  28.04 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.7 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  30.83 
 
 
311 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  26.55 
 
 
296 aa  69.3  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.82 
 
 
278 aa  66.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  31.4 
 
 
292 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  29.64 
 
 
303 aa  62.4  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.62 
 
 
325 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  32.34 
 
 
293 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  30.23 
 
 
292 aa  61.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  29.31 
 
 
395 aa  60.5  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.77 
 
 
317 aa  59.7  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  29.63 
 
 
307 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  30.81 
 
 
219 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.89 
 
 
310 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2916  DMT family permease  27.78 
 
 
297 aa  58.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  31.19 
 
 
397 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  31.09 
 
 
296 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.62 
 
 
310 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  24.48 
 
 
293 aa  57  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  28.05 
 
 
308 aa  56.6  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  32.73 
 
 
298 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  26.86 
 
 
293 aa  56.2  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  27 
 
 
295 aa  56.6  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  26.61 
 
 
308 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.56 
 
 
340 aa  55.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  27.18 
 
 
293 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.48 
 
 
293 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  24.13 
 
 
293 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  24.48 
 
 
293 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  31.33 
 
 
298 aa  53.9  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  27.75 
 
 
310 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00855  predicted permease  25.12 
 
 
309 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  31.33 
 
 
298 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  25.4 
 
 
286 aa  53.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  27.66 
 
 
308 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  25.7 
 
 
307 aa  52.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  25.71 
 
 
301 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2851  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
299 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17163 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1858  hypothetical protein  28.42 
 
 
304 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.38 
 
 
311 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  30.65 
 
 
364 aa  52.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  27.03 
 
 
309 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  28.38 
 
 
312 aa  50.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>