252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2851 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2851  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 299 aa  592  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17163 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3395  hypothetical protein  52.54 
 
 		 305 aa  333  2e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.2 
 
 		 303 aa  209  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1661  transporter DMT superfamily protein  26.15 
 
 		 297 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  24.23 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  28.57 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2608  transporter DMT superfamily protein  24.92 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1350  rarD protein  26.35 
 
 		 300 aa  92.8  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0599  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.13 
 
 		 302 aa  92.4  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1183  DMT superfamily efflux pump, RarD  25 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2968  RarD protein  29.43 
 
 		 295 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  27.36 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  27.36 
 
 		 294 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  27.36 
 
 		 294 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  28.62 
 
 		 302 aa  89.4  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1247  transporter DMT superfamily protein  24.57 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  0.0239516 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  26.97 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2317  RarD protein, DMT superfamily transporter  22.95 
 
 		 305 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000109763  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0080  RarD protein, DMT superfamily transporter  27.3 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0940  transporter DMT superfamily protein  27.65 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1952  rarD protein  26.09 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0477  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.96 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1207  rarD protein  25 
 
 		 319 aa  86.7  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  26.06 
 
 		 295 aa  86.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  27.12 
 
 		 295 aa  86.7  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0490  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.8 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.156296  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0680  rarD protein  24.17 
 
 		 306 aa  86.3  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.667831  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  24.17 
 
 		 297 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  25.27 
 
 		 294 aa  85.9  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0936  rarD protein  25.32 
 
 		 295 aa  85.5  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  26.49 
 
 		 295 aa  85.5  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0570  hypothetical protein  26.42 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  26.49 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1336  permease  23.44 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0328749  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  26.73 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  27.03 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  23.43 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0588  hypothetical protein  24.14 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0009394  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1859  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.07 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.898363  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  25.33 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  26.16 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  25.25 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  28.37 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06320  hypothetical protein  23.79 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257668  normal  0.652211 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  28.14 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  25.17 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0334  transporter DMT superfamily protein  26.12 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  23.1 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  22.77 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  25.61 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0672  RarD protein  23.91 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  28.01 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0621  transporter DMT superfamily protein  25.63 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000105334  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  24.67 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  24.67 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  24.67 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  23.41 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  24.67 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  27.8 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0535  transporter DMT superfamily protein  25.68 
 
 		 493 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.595832  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  24.67 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  24.67 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00198  Conserved membrane protein RarD  25.09 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.493256  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  28.12 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  27.66 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  27.66 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  27.66 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  26.46 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  27.66 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  26 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  26 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  26 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  27.49 
 
 		 313 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  24.51 
 
 		 335 aa  79  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2425  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.12 
 
 		 309 aa  79  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2949  transporter DMT superfamily protein  26.39 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  24.33 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  24.34 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  24.59 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  27.66 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  24.34 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2440  RarD protein, DMT superfamily transporter  21.18 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.659696  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  25.67 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  26.26 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  27.21 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0071  rarD protein  24.83 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1003  RarD protein, DMT superfamily transporter  23.67 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  25.26 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3544  RarD protein  24.22 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  23.66 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3395  RarD protein  23.18 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96482  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0508  permease  24.16 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.057497  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  26.4 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0891  transporter DMT superfamily protein  22.64 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  24.83 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0807  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.55 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00187361  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0811  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.55 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0657773  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02860  RarD protein  27.09 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0706  transporter DMT superfamily protein  25.82 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010497  hitchhiker  0.00122154 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0239  RarD protein, DMT superfamily transporter  24.91 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>