256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0157 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 303 aa  592  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2851  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.2 
 
 		 299 aa  235  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17163 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3395  hypothetical protein  38.65 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  28.33 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  27.67 
 
 		 295 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1661  transporter DMT superfamily protein  29.89 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  26.67 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1247  transporter DMT superfamily protein  27.92 
 
 		 316 aa  95.9  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  0.0239516 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.33 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  26.33 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0588  hypothetical protein  28.33 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0009394  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0936  rarD protein  25.68 
 
 		 295 aa  92.4  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  26.17 
 
 		 313 aa  92.4  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06320  hypothetical protein  28.47 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257668  normal  0.652211 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1207  rarD protein  27 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  28.19 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  28.42 
 
 		 294 aa  90.1  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  30 
 
 		 300 aa  89.4  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0851  RarD protein  26.79 
 
 		 292 aa  89.7  6e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0193705  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  29.02 
 
 		 295 aa  89.4  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  24.65 
 
 		 315 aa  89.4  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0778  RarD protein  30.85 
 
 		 290 aa  89.4  7e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  28.19 
 
 		 294 aa  89  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  28.19 
 
 		 294 aa  89  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  25.94 
 
 		 309 aa  89  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  28.19 
 
 		 294 aa  89  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  26.33 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1183  DMT superfamily efflux pump, RarD  27.53 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  26.79 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0717  transporter DMT superfamily protein  29.41 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.424655  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  27.5 
 
 		 294 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  25.98 
 
 		 313 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  26.79 
 
 		 295 aa  85.9  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  26.79 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  25.09 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4844  transporter DMT superfamily protein  26 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000446481  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  25.09 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2968  RarD protein  26.32 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2317  RarD protein, DMT superfamily transporter  27.78 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000109763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0599  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.44 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  24.91 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  24.91 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  24.91 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0604  RarD protein, DMT superfamily transporter  25.9 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.452707  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  24.91 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  24.91 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  24.91 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  27.92 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0706  RarD protein  26.38 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  26.06 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3697  transporter DMT superfamily protein  23.79 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  28.1 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0796  RarD protein  29.23 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000337641  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  27.81 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  27.43 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4080  transporter DMT superfamily protein  24.92 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1350  rarD protein  25.52 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  28.17 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  25.09 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  26.83 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  27.81 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0795  RarD protein  29.58 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0595503  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  26.21 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  25.5 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  27.02 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0760  hypothetical protein  25.96 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  26 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0621  transporter DMT superfamily protein  26.41 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000105334  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  26.82 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  26.48 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2967  RarD protein, DMT superfamily transporter  28.52 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.895178 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  26.48 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.48 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  26.48 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  26.48 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  26.48 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  24.84 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  26.48 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3395  RarD protein  24.91 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96482  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  26.28 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1336  permease  25.75 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0328749  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0190  transporter DMT superfamily protein  27.95 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.7183 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0508  permease  25.94 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.057497  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5070  RarD protein, DMT superfamily transporter  24.08 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  24.23 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0249  RarD protein, DMT superfamily transporter  25.34 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00198  Conserved membrane protein RarD  27.6 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.493256  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  30.11 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0811  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.79 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0657773  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0891  transporter DMT superfamily protein  26.41 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0807  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.79 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00187361  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0297  RarD protein, DMT superfamily transporter  25.25 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  28.17 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0806  transporter DMT superfamily protein  24.54 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.86594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0490  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.82 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.156296  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0483  rarD protein  27 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000325655  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1952  rarD protein  27.27 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23910  rarD protein  25.09 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00670263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2608  transporter DMT superfamily protein  24.51 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2719  transporter DMT superfamily protein  25.78 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>