219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3697 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3697  transporter DMT superfamily protein  100 
 
 		 296 aa  593  1e-168  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3149  RarD protein  31.46 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3312  RarD protein  31.09 
 
 		 304 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.284877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3132  RarD protein  31.46 
 
 		 304 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341104  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3198  hypothetical protein  31.46 
 
 		 304 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3212  RarD protein  31.46 
 
 		 304 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.715099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05888  hypothetical protein  30.95 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0076  integral membrane protein  33.33 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0706  transporter DMT superfamily protein  29.37 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010497  hitchhiker  0.00122154 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1861  transporter DMT superfamily protein  29.3 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0778  RarD protein  29.85 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  29.76 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0796  RarD protein  30.37 
 
 		 290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000337641  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4258  transporter DMT superfamily protein  28.94 
 
 		 327 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.795414  hitchhiker  0.00375381 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000278  RarD protein  29.35 
 
 		 301 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0795  RarD protein  32.85 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0595503  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2719  transporter DMT superfamily protein  28.32 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2776  transporter DMT superfamily protein  28.32 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0152  RarD protein  29.86 
 
 		 276 aa  126  5e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.886029  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  30 
 
 		 296 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  30 
 
 		 296 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  30 
 
 		 296 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  30 
 
 		 296 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  30 
 
 		 296 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  30 
 
 		 296 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  30.1 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  30.71 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  28.37 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  26.5 
 
 		 295 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  29.76 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  29.79 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  26.39 
 
 		 304 aa  123  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  26.87 
 
 		 294 aa  122  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  26.6 
 
 		 294 aa  122  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  26.87 
 
 		 294 aa  122  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  27.3 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3322  transporter DMT superfamily protein  27.14 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2440  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.59 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.659696  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0717  transporter DMT superfamily protein  26.79 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.424655  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  25.44 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.94 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00198  Conserved membrane protein RarD  29.21 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.493256  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.49 
 
 		 294 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  26.37 
 
 		 308 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  29.86 
 
 		 294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1350  rarD protein  25.87 
 
 		 300 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  30.43 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  30.43 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  30.43 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  26.49 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  26.49 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  26.49 
 
 		 294 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  27.46 
 
 		 335 aa  118  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1207  rarD protein  26.12 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  27.4 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0599  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.28 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1183  DMT superfamily efflux pump, RarD  26.12 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  25.93 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  28.52 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  28.28 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  26.06 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0297  RarD protein, DMT superfamily transporter  27.01 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4018  rarD protein  27.68 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  26.57 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0806  transporter DMT superfamily protein  26.57 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.86594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  26.12 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3395  RarD protein  25 
 
 		 301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96482  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2317  RarD protein, DMT superfamily transporter  27.68 
 
 		 305 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000109763  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  27.55 
 
 		 306 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23910  rarD protein  28.52 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00670263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5070  RarD protein, DMT superfamily transporter  25.7 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  24.18 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2967  RarD protein, DMT superfamily transporter  24.83 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.895178 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0190  RarD protein, DMT superfamily transporter  29.67 
 
 		 306 aa  112  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  27.21 
 
 		 294 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1661  transporter DMT superfamily protein  25 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0621  transporter DMT superfamily protein  25.65 
 
 		 318 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000105334  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0239  RarD protein, DMT superfamily transporter  27.55 
 
 		 306 aa  112  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  25.17 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  26.2 
 
 		 296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1118  rarD protein  27.07 
 
 		 295 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  25.18 
 
 		 303 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  27.04 
 
 		 296 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  27.04 
 
 		 296 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  27.04 
 
 		 296 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  25.42 
 
 		 313 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0490  RarD protein, DMT superfamily transporter  28.31 
 
 		 298 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.156296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0080  RarD protein, DMT superfamily transporter  28.88 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0477  RarD protein, DMT superfamily transporter  28.31 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2877  transporter DMT superfamily protein  23.96 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1952  rarD protein  24.54 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0332  rarD protein  27.84 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  25.74 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  25.09 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  24.08 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  24.41 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0570  hypothetical protein  28.21 
 
 		 298 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  24.08 
 
 		 313 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  24.08 
 
 		 313 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1030  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.28 
 
 		 305 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>