224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0076 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0076  integral membrane protein  100 
 
 		 283 aa  561  1.0000000000000001e-159  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3697  transporter DMT superfamily protein  33.33 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3322  transporter DMT superfamily protein  30.15 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4258  transporter DMT superfamily protein  31.07 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.795414  hitchhiker  0.00375381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0706  transporter DMT superfamily protein  30.55 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010497  hitchhiker  0.00122154 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  28.03 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1861  transporter DMT superfamily protein  28.57 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3395  RarD protein  29.15 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96482  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3149  RarD protein  32.03 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0778  RarD protein  30.26 
 
 		 290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3132  RarD protein  31.64 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341104  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3198  hypothetical protein  31.64 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2317  RarD protein, DMT superfamily transporter  28.99 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000109763  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3312  RarD protein  31.91 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.284877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1350  rarD protein  26.86 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05888  hypothetical protein  31.35 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000278  RarD protein  30.98 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1207  rarD protein  26.76 
 
 		 319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0795  RarD protein  27.9 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0595503  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1183  DMT superfamily efflux pump, RarD  27.62 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2968  RarD protein  26.62 
 
 		 295 aa  115  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  26.6 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  26.74 
 
 		 294 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3212  RarD protein  31.25 
 
 		 304 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.715099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0851  RarD protein  29.39 
 
 		 292 aa  112  5e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0193705  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1247  transporter DMT superfamily protein  25.44 
 
 		 316 aa  112  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  0.0239516 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0490  RarD protein, DMT superfamily transporter  27.08 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.156296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1661  transporter DMT superfamily protein  25.09 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2719  transporter DMT superfamily protein  27.87 
 
 		 302 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2776  transporter DMT superfamily protein  27.87 
 
 		 302 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  27.6 
 
 		 304 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  26.43 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2949  transporter DMT superfamily protein  27.46 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  24.83 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  27.4 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  26.28 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0477  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.41 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3544  RarD protein  26.17 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0891  transporter DMT superfamily protein  24.04 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  25.89 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  27.3 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4018  rarD protein  25.77 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.92 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0570  hypothetical protein  27.74 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  27.45 
 
 		 305 aa  105  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1110  transporter DMT superfamily protein  28.41 
 
 		 313 aa  105  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  25.78 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  26.21 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  26.42 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  25.27 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  25.52 
 
 		 301 aa  102  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  23.83 
 
 		 295 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0806  transporter DMT superfamily protein  25.29 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.86594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  23.36 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.19 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  24.03 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  26.19 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0796  RarD protein  28.35 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000337641  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  26.19 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  26.19 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  26.91 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5070  RarD protein, DMT superfamily transporter  29.63 
 
 		 351 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  24.71 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  26.91 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0717  transporter DMT superfamily protein  28.29 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.424655  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  22.61 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02860  RarD protein  27.66 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  25.59 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  26.91 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  26.91 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0080  RarD protein, DMT superfamily transporter  28.04 
 
 		 292 aa  99.8  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1118  rarD protein  26.67 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0071  rarD protein  23.79 
 
 		 311 aa  99.8  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1178  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.69 
 
 		 304 aa  99.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  25.79 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  23.1 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  25.3 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  25.42 
 
 		 313 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  23.91 
 
 		 302 aa  99.4  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  26.37 
 
 		 313 aa  99  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  25.93 
 
 		 313 aa  99  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0706  RarD protein  23.93 
 
 		 310 aa  98.6  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0190  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.69 
 
 		 306 aa  98.6  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0760  hypothetical protein  25.81 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  25.08 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  26.57 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.57 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  26.57 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  25.42 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  25.42 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  25.42 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1030  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.34 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  26.57 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23910  rarD protein  23.86 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00670263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  26.57 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  26.57 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  27.53 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  27.53 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  27.53 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  25.42 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>