239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000278 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000278  RarD protein  100 
 
 		 301 aa  602  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05888  hypothetical protein  79.73 
 
 		 301 aa  496  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1861  transporter DMT superfamily protein  52.35 
 
 		 313 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4258  transporter DMT superfamily protein  51.01 
 
 		 327 aa  291  8e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.795414  hitchhiker  0.00375381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0706  transporter DMT superfamily protein  50.17 
 
 		 309 aa  290  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010497  hitchhiker  0.00122154 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3322  transporter DMT superfamily protein  48.48 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3312  RarD protein  40.75 
 
 		 304 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.284877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3149  RarD protein  40.75 
 
 		 304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3132  RarD protein  40.75 
 
 		 304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341104  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3198  hypothetical protein  40.75 
 
 		 304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3212  RarD protein  40.41 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.715099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  36.09 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  37.37 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  36.73 
 
 		 296 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  36.73 
 
 		 296 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  36.73 
 
 		 296 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  37.09 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0190  transporter DMT superfamily protein  37.04 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.7183 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  34.23 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  35.1 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  35.79 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  35.71 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  35.25 
 
 		 298 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  34.92 
 
 		 335 aa  176  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  35.25 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  35.25 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  35.25 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  35.25 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  35.25 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  35.25 
 
 		 295 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  35.25 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  35.25 
 
 		 295 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  35.25 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  35.25 
 
 		 295 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  35.91 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  35.03 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  35.35 
 
 		 298 aa  172  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  36.82 
 
 		 295 aa  172  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  34.69 
 
 		 295 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  36.15 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  36.15 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0717  transporter DMT superfamily protein  37.2 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.424655  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  36.52 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  36.52 
 
 		 294 aa  168  9e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  34.65 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  33.99 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  33.99 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  33.99 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  35 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  33.99 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  35.82 
 
 		 313 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  33.99 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  34.65 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  34.33 
 
 		 302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  33.99 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0621  transporter DMT superfamily protein  34.41 
 
 		 318 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000105334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  33.99 
 
 		 313 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  37.25 
 
 		 298 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  33.33 
 
 		 304 aa  165  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  32.5 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  32.99 
 
 		 300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  33.56 
 
 		 300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  34.48 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  35.74 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  34.58 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  35.74 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  35.74 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  35.74 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0190  RarD protein, DMT superfamily transporter  35.31 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  35.74 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  33.57 
 
 		 308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  35.89 
 
 		 303 aa  162  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2317  RarD protein, DMT superfamily transporter  32 
 
 		 305 aa  162  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000109763  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3395  RarD protein  35.96 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96482  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0778  RarD protein  33.94 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  30.48 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2776  transporter DMT superfamily protein  31.13 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2719  transporter DMT superfamily protein  31.13 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  33.88 
 
 		 306 aa  158  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1336  permease  31.91 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0328749  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  32.08 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00198  Conserved membrane protein RarD  34.24 
 
 		 310 aa  155  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.493256  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  33.98 
 
 		 296 aa  155  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1859  RarD protein, DMT superfamily transporter  37.06 
 
 		 310 aa  155  9e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.898363  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0239  RarD protein, DMT superfamily transporter  32.23 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1350  rarD protein  34.59 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0071  rarD protein  31.16 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0332  rarD protein  36.59 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  29.11 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  29.79 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0795  RarD protein  32.99 
 
 		 292 aa  153  4e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0595503  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  29.11 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1183  DMT superfamily efflux pump, RarD  31.33 
 
 		 319 aa  152  7e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23910  rarD protein  29.83 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00670263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0796  RarD protein  31.91 
 
 		 290 aa  149  4e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000337641  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1207  rarD protein  30.69 
 
 		 319 aa  150  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4018  rarD protein  33.22 
 
 		 316 aa  149  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0811  RarD protein, DMT superfamily transporter  34.95 
 
 		 301 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0657773  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0807  RarD protein, DMT superfamily transporter  34.95 
 
 		 301 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00187361  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1118  rarD protein  32.39 
 
 		 295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>