241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05888 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05888  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  597  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000278  RarD protein  79.73 
 
 		 301 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1861  transporter DMT superfamily protein  49.17 
 
 		 313 aa  297  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4258  transporter DMT superfamily protein  49.01 
 
 		 327 aa  290  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.795414  hitchhiker  0.00375381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0706  transporter DMT superfamily protein  49.15 
 
 		 309 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010497  hitchhiker  0.00122154 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3322  transporter DMT superfamily protein  49.17 
 
 		 308 aa  277  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3312  RarD protein  40.69 
 
 		 304 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.284877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3132  RarD protein  40.34 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341104  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3149  RarD protein  40 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3198  hypothetical protein  40.34 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3212  RarD protein  40 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.715099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  37.71 
 
 		 305 aa  192  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  35.22 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  37.79 
 
 		 304 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  37.33 
 
 		 305 aa  189  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  37.54 
 
 		 309 aa  187  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  35.93 
 
 		 335 aa  185  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  37.94 
 
 		 309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  36.36 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  35.74 
 
 		 295 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  35.64 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  35.64 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  35.64 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  36.9 
 
 		 294 aa  182  6e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  36.36 
 
 		 294 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  37.63 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  39.44 
 
 		 295 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  36.61 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  36.61 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  36.61 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  37.5 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0190  transporter DMT superfamily protein  36.77 
 
 		 295 aa  179  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.7183 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  36.61 
 
 		 294 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  36.64 
 
 		 295 aa  177  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  36.52 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  36.3 
 
 		 298 aa  176  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  35.29 
 
 		 295 aa  176  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  35.74 
 
 		 313 aa  175  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  35.74 
 
 		 313 aa  175  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  35.74 
 
 		 313 aa  175  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  35.74 
 
 		 313 aa  175  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  32.76 
 
 		 295 aa  175  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  35.74 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  33.45 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  35.29 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  35.61 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  35.74 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  35.91 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  34.95 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  35.4 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  35.74 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  35.4 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  35.4 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  35.07 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  35.07 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  35.07 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  35.07 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  35.07 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  35.05 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  35.07 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  35.46 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  35.74 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  36.33 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0717  transporter DMT superfamily protein  36.43 
 
 		 294 aa  172  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.424655  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2317  RarD protein, DMT superfamily transporter  34.52 
 
 		 305 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000109763  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  35.86 
 
 		 298 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  34.02 
 
 		 298 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1350  rarD protein  35.45 
 
 		 300 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3395  RarD protein  37.8 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96482  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  31.27 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  31.62 
 
 		 295 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  33.22 
 
 		 304 aa  169  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  32.42 
 
 		 297 aa  169  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  31.27 
 
 		 295 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  36.88 
 
 		 296 aa  169  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0621  transporter DMT superfamily protein  35.25 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000105334  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00198  Conserved membrane protein RarD  36.43 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.493256  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0190  RarD protein, DMT superfamily transporter  35.08 
 
 		 306 aa  165  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  32.89 
 
 		 315 aa  165  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0239  RarD protein, DMT superfamily transporter  35.37 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0332  rarD protein  35.9 
 
 		 293 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  34.34 
 
 		 302 aa  162  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  36.58 
 
 		 306 aa  162  9e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0778  RarD protein  33.56 
 
 		 290 aa  159  6e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3092  transporter DMT superfamily protein  32.67 
 
 		 310 aa  159  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652908  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  32.62 
 
 		 301 aa  157  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2719  transporter DMT superfamily protein  33.89 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0071  rarD protein  31.6 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2776  transporter DMT superfamily protein  33.89 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  36.43 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1859  RarD protein, DMT superfamily transporter  34.98 
 
 		 310 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.898363  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0806  transporter DMT superfamily protein  34.48 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.86594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23910  rarD protein  30.46 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00670263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  34.8 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1661  transporter DMT superfamily protein  32.31 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0570  hypothetical protein  34.01 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0811  RarD protein, DMT superfamily transporter  33.9 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0657773  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0807  RarD protein, DMT superfamily transporter  33.9 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00187361  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2792  RarD protein, DMT superfamily transporter  34.52 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0490  RarD protein, DMT superfamily transporter  34.59 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.156296  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>