251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1178 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1178  RarD protein, DMT superfamily transporter  100 
 
 		 304 aa  597  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1030  RarD protein, DMT superfamily transporter  96.71 
 
 		 305 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0719  transporter DMT superfamily protein  71.96 
 
 		 313 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1476  hypothetical protein  64.71 
 
 		 307 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0071  rarD protein  62.24 
 
 		 311 aa  378  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3520  rarD protein  59.59 
 
 		 296 aa  342  5.999999999999999e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194559 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4067  transporter DMT superfamily protein  64.21 
 
 		 299 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3340  RarD family protein  63.88 
 
 		 299 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3228  hypothetical protein  61.67 
 
 		 317 aa  329  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0970  transporter DMT superfamily protein  57.24 
 
 		 306 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0101189  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2608  transporter DMT superfamily protein  52.63 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0680  rarD protein  51.51 
 
 		 306 aa  291  6e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.667831  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0672  RarD protein  52.67 
 
 		 290 aa  278  5e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  45.18 
 
 		 303 aa  242  7e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  40.21 
 
 		 295 aa  225  7e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  39.18 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0599  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.83 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.62 
 
 		 309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1952  rarD protein  41.72 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0806  transporter DMT superfamily protein  41.05 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.86594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  40.74 
 
 		 335 aa  216  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  39.18 
 
 		 295 aa  216  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  41.08 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  41.13 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  40.41 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  40.41 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  40.41 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  40.41 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  40.41 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  40.41 
 
 		 313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  36.99 
 
 		 304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0717  transporter DMT superfamily protein  40.43 
 
 		 294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.424655  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  40.07 
 
 		 313 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  40.07 
 
 		 313 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3395  RarD protein  42.96 
 
 		 301 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96482  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0080  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.39 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.34 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  40.89 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  37.89 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  37.46 
 
 		 300 aa  210  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  40.21 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0249  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.41 
 
 		 298 aa  208  8e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1661  transporter DMT superfamily protein  39.78 
 
 		 297 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  37.06 
 
 		 294 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  37.06 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  37.8 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  40.79 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  36.71 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  36.95 
 
 		 305 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  37.06 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1350  rarD protein  42.76 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.84 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  38.41 
 
 		 300 aa  203  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  35.89 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.44 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  38.57 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  35.89 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  35.89 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  35.89 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  40.14 
 
 		 304 aa  202  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  36.01 
 
 		 294 aa  201  9e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  38.95 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2967  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.34 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.895178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0490  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.56 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.156296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6667  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.07 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605512  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  38.36 
 
 		 301 aa  199  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0332  rarD protein  36.95 
 
 		 293 aa  200  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  36.86 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0621  transporter DMT superfamily protein  39.49 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000105334  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.65 
 
 		 295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0477  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.78 
 
 		 298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0936  rarD protein  39.16 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0190  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.21 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3544  RarD protein  40.43 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2719  transporter DMT superfamily protein  38.36 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2776  transporter DMT superfamily protein  38.36 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  38.3 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1247  transporter DMT superfamily protein  36.52 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  0.0239516 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  37.24 
 
 		 309 aa  196  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00198  Conserved membrane protein RarD  37.04 
 
 		 310 aa  195  9e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.493256  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0807  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.67 
 
 		 301 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00187361  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  39.21 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0811  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.67 
 
 		 301 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0657773  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  33.56 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  36.9 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3677  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.05 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  37.67 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0796  RarD protein  37.14 
 
 		 290 aa  193  3e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000337641  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1428  rarD protein  38.89 
 
 		 304 aa  193  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.242387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0239  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.15 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0760  hypothetical protein  43.79 
 
 		 301 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1003  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.41 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3092  transporter DMT superfamily protein  37.29 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652908  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0334  transporter DMT superfamily protein  40.2 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2317  RarD protein, DMT superfamily transporter  35.92 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000109763  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0604  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.44 
 
 		 307 aa  189  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.452707  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0570  hypothetical protein  39.93 
 
 		 298 aa  189  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2968  RarD protein  38.89 
 
 		 295 aa  188  7e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4844  transporter DMT superfamily protein  39.36 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000446481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2792  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.7 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>