238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0152 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0152  RarD protein  100 
 
 		 276 aa  546  1e-154  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.886029  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0796  RarD protein  62.45 
 
 		 290 aa  347  1e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000337641  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0778  RarD protein  46.89 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0851  RarD protein  41.45 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0193705  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0795  RarD protein  42.96 
 
 		 292 aa  229  3e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0595503  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  39.57 
 
 		 305 aa  208  7e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  40.78 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  41.16 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  41.01 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1952  rarD protein  40.22 
 
 		 307 aa  206  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  41.01 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  41.01 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  40.58 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  38.43 
 
 		 295 aa  205  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  37.82 
 
 		 300 aa  205  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  41.01 
 
 		 295 aa  205  8e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.15 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  39.57 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  40.65 
 
 		 301 aa  203  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  39.15 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  40.5 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.5 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  40.5 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  40.5 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  40.5 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  40.65 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  40.5 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  38.49 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  39.49 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  40.29 
 
 		 304 aa  199  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  39.57 
 
 		 295 aa  199  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0621  transporter DMT superfamily protein  39.42 
 
 		 318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000105334  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.13 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  37.05 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  37.27 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0717  transporter DMT superfamily protein  38.91 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.424655  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  38.87 
 
 		 296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0190  transporter DMT superfamily protein  39.13 
 
 		 295 aa  195  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.7183 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  37.17 
 
 		 303 aa  195  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0332  rarD protein  39.86 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  38.77 
 
 		 295 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1350  rarD protein  36.46 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  38.71 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  39.13 
 
 		 294 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.04 
 
 		 309 aa  193  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  38.77 
 
 		 294 aa  192  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4844  transporter DMT superfamily protein  39.5 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000446481  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  38.85 
 
 		 294 aa  192  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  38.77 
 
 		 295 aa  192  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0190  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.41 
 
 		 306 aa  192  7e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  37.46 
 
 		 297 aa  192  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  38.85 
 
 		 302 aa  191  8e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0334  transporter DMT superfamily protein  39.35 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.41 
 
 		 294 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06320  hypothetical protein  37.82 
 
 		 298 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257668  normal  0.652211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0588  hypothetical protein  37.45 
 
 		 298 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0009394  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  38.41 
 
 		 294 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  38.41 
 
 		 294 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0719  transporter DMT superfamily protein  39.18 
 
 		 313 aa  188  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  38.41 
 
 		 294 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  38.27 
 
 		 294 aa  188  7e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0806  transporter DMT superfamily protein  36.88 
 
 		 300 aa  188  8e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.86594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  36.23 
 
 		 296 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  36.23 
 
 		 296 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  36.23 
 
 		 296 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0535  transporter DMT superfamily protein  36.46 
 
 		 493 aa  186  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.595832  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  35.97 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4698  RarD protein  38.97 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000777154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2967  RarD protein, DMT superfamily transporter  36.69 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.895178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  36.82 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1476  hypothetical protein  36.52 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0599  RarD protein, DMT superfamily transporter  36.33 
 
 		 302 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1661  transporter DMT superfamily protein  35.27 
 
 		 297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0483  rarD protein  39.34 
 
 		 295 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000325655  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2776  transporter DMT superfamily protein  36.62 
 
 		 302 aa  182  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2719  transporter DMT superfamily protein  36.62 
 
 		 302 aa  182  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  39.05 
 
 		 315 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  36.1 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2949  transporter DMT superfamily protein  37.92 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  35.16 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0071  rarD protein  35.14 
 
 		 311 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0239  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.13 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3228  hypothetical protein  35.51 
 
 		 317 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2608  transporter DMT superfamily protein  33.81 
 
 		 325 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  38.69 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0680  rarD protein  34.89 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.667831  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  38.69 
 
 		 313 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  38.69 
 
 		 313 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  38.69 
 
 		 313 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  38.69 
 
 		 313 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1207  rarD protein  33.57 
 
 		 319 aa  176  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0807  RarD protein, DMT superfamily transporter  36.23 
 
 		 301 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00187361  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0811  RarD protein, DMT superfamily transporter  36.23 
 
 		 301 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0657773  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  34.28 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  32.62 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  38.69 
 
 		 313 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  38.69 
 
 		 313 aa  175  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00198  Conserved membrane protein RarD  36.56 
 
 		 310 aa  175  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.493256  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1030  RarD protein, DMT superfamily transporter  37.36 
 
 		 305 aa  175  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4619  transporter DMT superfamily protein  35.14 
 
 		 305 aa  175  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.664624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>