195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1024 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  100 
 
 		 293 aa  582  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  39.93 
 
 		 292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  38.75 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  38.75 
 
 		 293 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.75 
 
 		 293 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  38.75 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  38.41 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  37.72 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  39.79 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  36.49 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0556  hypothetical protein  38.62 
 
 		 296 aa  176  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  36.36 
 
 		 290 aa  176  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  39.1 
 
 		 294 aa  175  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  39.1 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  37.41 
 
 		 292 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  35.62 
 
 		 298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  35.11 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  34.75 
 
 		 288 aa  155  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.5 
 
 		 282 aa  119  7e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  31.41 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588.2  DMT family permease  45.86 
 
 		 145 aa  109  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  28.57 
 
 		 283 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.23 
 
 		 296 aa  102  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22560  putative permease  30.55 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000360321  hitchhiker  0.0000288178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  32.39 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  28.62 
 
 		 309 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  29.97 
 
 		 297 aa  89  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.55 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3801  hypothetical protein  32.32 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000662683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4512  hypothetical protein  31.16 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  25.47 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  28.44 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1399  hypothetical protein  30.43 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.137527  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0043  hypothetical protein  24.66 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.355426  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.33 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  26.69 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4018  hypothetical protein  31.29 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321075 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.77 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.59 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000287238 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  33 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.26 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  25.91 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  25.91 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  25.91 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  25.91 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  25.91 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  25.91 
 
 		 289 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  25.91 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00855  predicted permease  21.11 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.26 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.86 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.51 
 
 		 329 aa  65.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.7 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.48 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.39 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  24.67 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  22.46 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.42 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4038  hypothetical protein  23.69 
 
 		 287 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  26.75 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  27.52 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3004  hypothetical protein  24.69 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  27.63 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  26.14 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  26.35 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.37 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2338  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.72 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0424523  normal  0.230999 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  27.35 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04828  integral membrane protein DUF6  23.83 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  24.91 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  23.86 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  23.1 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  26.69 
 
 		 281 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1231  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.98 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  21.94 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.68 
 
 		 300 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  26.11 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0189  hypothetical protein  24.07 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  25.95 
 
 		 308 aa  53.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  25.56 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  23.44 
 
 		 307 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  25.12 
 
 		 308 aa  52.4  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  25.36 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.96 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  23.25 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.65 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.24 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.59 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  24.77 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  26.5 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  23.25 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  23.94 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  23.25 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  24.31 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  24.72 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.35 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.51 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.13 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.38 
 
 		 299 aa  50.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>