198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0416 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0416  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  616  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  42.44 
 
 
301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  47.6 
 
 
304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.35 
 
 
329 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  42.23 
 
 
300 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  42.23 
 
 
300 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  42.23 
 
 
300 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  41.36 
 
 
298 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  42.07 
 
 
302 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  40.13 
 
 
307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  40.13 
 
 
307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  41.84 
 
 
512 aa  222  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  42.18 
 
 
343 aa  222  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6312  hypothetical protein  42.91 
 
 
300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  41.84 
 
 
343 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.07 
 
 
313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.07 
 
 
300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  40.54 
 
 
306 aa  219  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  38.75 
 
 
299 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3010  hypothetical protein  41.41 
 
 
300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  40.98 
 
 
298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0435  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.92 
 
 
299 aa  212  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  42.18 
 
 
318 aa  208  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2040  hypothetical protein  44.44 
 
 
308 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.136673  normal  0.653396 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2873  hypothetical protein  41.41 
 
 
300 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  40.73 
 
 
299 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.98 
 
 
300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  41.03 
 
 
304 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.27 
 
 
300 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22136  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  41.16 
 
 
298 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  40.71 
 
 
255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2640  hypothetical protein  37.09 
 
 
299 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0189  hypothetical protein  38.51 
 
 
295 aa  179  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
306 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  33.89 
 
 
307 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3724  hypothetical protein  36.76 
 
 
272 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  31.95 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  29.21 
 
 
307 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  29.55 
 
 
302 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  29.55 
 
 
302 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  29.71 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  30 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  29.66 
 
 
300 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  29.55 
 
 
300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  29.18 
 
 
289 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.28 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  28.25 
 
 
311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.93 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  27.56 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3334  hypothetical protein  36.93 
 
 
315 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  29.76 
 
 
316 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  28.16 
 
 
293 aa  94  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.4 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  26.69 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  25 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  25.86 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  25 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2916  DMT family permease  27.6 
 
 
297 aa  63.9  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  23.64 
 
 
302 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  25.59 
 
 
301 aa  59.3  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  27.23 
 
 
312 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.51 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0579  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.11 
 
 
324 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  23.93 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  22.61 
 
 
290 aa  57.4  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3601  hypothetical protein  24.04 
 
 
329 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4040  integral membrane domain-containing protein  23.69 
 
 
349 aa  57  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0573  hypothetical protein  24.3 
 
 
324 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3427  hypothetical protein  24.04 
 
 
329 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3761  hypothetical protein  24.3 
 
 
324 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0549  hypothetical protein  24.3 
 
 
324 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0168  hypothetical protein  24.89 
 
 
309 aa  57  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  21.86 
 
 
293 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  24.58 
 
 
308 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  22.99 
 
 
294 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0525  hypothetical protein  23.34 
 
 
329 aa  56.2  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.88 
 
 
317 aa  55.8  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  21.86 
 
 
293 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.68 
 
 
293 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  24.13 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  23.38 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.3 
 
 
278 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0634  hypothetical protein  24.54 
 
 
339 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  25.57 
 
 
297 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  22.36 
 
 
293 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  24.89 
 
 
307 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  22.83 
 
 
397 aa  53.5  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  23.53 
 
 
293 aa  53.1  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.47 
 
 
301 aa  52.8  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2338  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.66 
 
 
293 aa  52.8  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0424523  normal  0.230999 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  25.81 
 
 
295 aa  52.8  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  24.6 
 
 
308 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  25.43 
 
 
305 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  28.14 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  25.13 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  25 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  28.14 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  24.91 
 
 
292 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  21.84 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>