106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4040 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4040  integral membrane domain-containing protein  100 
 
 		 349 aa  695    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3601  hypothetical protein  96.59 
 
 		 329 aa  625  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3427  hypothetical protein  95.98 
 
 		 329 aa  623  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0525  hypothetical protein  95.98 
 
 		 329 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3761  hypothetical protein  88.51 
 
 		 324 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0549  hypothetical protein  88.51 
 
 		 324 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0573  hypothetical protein  88.51 
 
 		 324 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0579  protein of unknown function DUF6 transmembrane  88.51 
 
 		 324 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0634  hypothetical protein  85.45 
 
 		 339 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0631  hypothetical protein  70.82 
 
 		 320 aa  428  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.789426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0565  hypothetical protein  68.81 
 
 		 325 aa  420  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3715  hypothetical protein  66.24 
 
 		 322 aa  413  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0498  integral membrane domain-containing protein  65.99 
 
 		 316 aa  384  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4064  hypothetical protein  52.13 
 
 		 321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4978  hypothetical protein  34.24 
 
 		 305 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3610  integral membrane protein  32.66 
 
 		 328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000195591  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3755  hypothetical protein  32.66 
 
 		 328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000395481  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3976  hypothetical protein  31.73 
 
 		 312 aa  152  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000242668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0475  hypothetical protein  32.09 
 
 		 334 aa  152  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000164528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4094  hypothetical protein  34.58 
 
 		 319 aa  149  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1361  hypothetical protein  35.22 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00507818  normal  0.397175 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3975  hypothetical protein  32.21 
 
 		 312 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3663  hypothetical protein  33.44 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1686  hypothetical protein  33.66 
 
 		 328 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.658717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0560  hypothetical protein  31.65 
 
 		 320 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00477006  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0795  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.99 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3961  hypothetical protein  34.23 
 
 		 324 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.761458  normal  0.0378456 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1729  hypothetical protein  33.77 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35536  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1753  hypothetical protein  33.78 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1345  hypothetical protein  34.22 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0815858  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3352  membrane protein  31.79 
 
 		 311 aa  139  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3620  hypothetical protein  32.67 
 
 		 321 aa  139  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000693359  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3586  putative transporter  32.67 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000241  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3563  putative transporter  32.33 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3599  putative transporter  32.33 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0879234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3494  putative transporter  32.33 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00919199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3492  putative transporter  32.33 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543428  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.08 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000192809  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0247  hypothetical protein  31.38 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00278162  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.76 
 
 		 306 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00208172  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03049  conserved inner membrane protein  32.33 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00601022  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.33 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000715039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3377  putative transporter  32.33 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.82024e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3669  putative transporter  32.33 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000521429  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0516  hypothetical protein  32.33 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000278585  hitchhiker  0.00919443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3480  putative transporter  32.33 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000496501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03000  hypothetical protein  32.33 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00567967  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4506  putative transporter  31.21 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000436684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  22.22 
 
 		 315 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  25 
 
 		 303 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  25 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  25 
 
 		 303 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  24.06 
 
 		 341 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  23.4 
 
 		 299 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  25 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  25.33 
 
 		 303 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  25.33 
 
 		 303 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  25 
 
 		 303 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  23.47 
 
 		 299 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  23.68 
 
 		 303 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0416  hypothetical protein  23.69 
 
 		 312 aa  50.1  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  23.47 
 
 		 299 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  23.4 
 
 		 299 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  23.4 
 
 		 299 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  23.47 
 
 		 299 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  23.75 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.15 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  24.34 
 
 		 303 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  22.83 
 
 		 299 aa  47.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  27.96 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.55 
 
 		 301 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  23.68 
 
 		 299 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  24.91 
 
 		 296 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  23.83 
 
 		 305 aa  46.2  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  30.28 
 
 		 296 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  26.16 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  26.16 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  26.16 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0354  hypothetical protein  23.46 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  24.2 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  24.87 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2187  hypothetical protein  25.93 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0754091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.09 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  22.86 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  26.16 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  30.37 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  22.78 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  25.27 
 
 		 395 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  28.32 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  25.58 
 
 		 296 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2232  hypothetical protein  25.23 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2047  hypothetical protein  23.6 
 
 		 314 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.26 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  25.58 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3198  hypothetical protein  23.62 
 
 		 304 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3132  RarD protein  23.62 
 
 		 304 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341104  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  25.91 
 
 		 297 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3149  RarD protein  23.62 
 
 		 304 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  24.15 
 
 		 297 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  26.12 
 
 		 304 aa  43.1  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>