115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0579 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3761  hypothetical protein  98.46 
 
 
324 aa  635    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0573  hypothetical protein  98.46 
 
 
324 aa  635    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0579  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
324 aa  643    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0549  hypothetical protein  98.45 
 
 
324 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0634  hypothetical protein  89.51 
 
 
339 aa  590  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4040  integral membrane domain-containing protein  88.51 
 
 
349 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3427  hypothetical protein  87.35 
 
 
329 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0525  hypothetical protein  87.65 
 
 
329 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3601  hypothetical protein  87.65 
 
 
329 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0631  hypothetical protein  71.38 
 
 
320 aa  427  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.789426 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3715  hypothetical protein  67.3 
 
 
322 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0565  hypothetical protein  67.69 
 
 
325 aa  421  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0498  integral membrane domain-containing protein  64.21 
 
 
316 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4064  hypothetical protein  50.65 
 
 
321 aa  301  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4978  hypothetical protein  33.68 
 
 
305 aa  159  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3975  hypothetical protein  31.23 
 
 
312 aa  153  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4094  hypothetical protein  33.56 
 
 
319 aa  149  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3610  integral membrane protein  31.56 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000195591  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3976  hypothetical protein  31.56 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000242668  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3755  hypothetical protein  31.56 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000395481  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1686  hypothetical protein  33.33 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.658717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0475  hypothetical protein  32.33 
 
 
334 aa  145  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000164528  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3352  membrane protein  33.97 
 
 
311 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0560  hypothetical protein  31.33 
 
 
320 aa  142  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00477006  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3663  hypothetical protein  32.45 
 
 
319 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0795  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.1 
 
 
320 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1729  hypothetical protein  32.89 
 
 
320 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35536  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3961  hypothetical protein  33.44 
 
 
324 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.761458  normal  0.0378456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1753  hypothetical protein  33.11 
 
 
324 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1361  hypothetical protein  33.89 
 
 
320 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00507818  normal  0.397175 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1345  hypothetical protein  33.55 
 
 
320 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0815858  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.54 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000192809  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.76 
 
 
306 aa  132  6.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00208172  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3620  hypothetical protein  31.67 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000693359  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0247  hypothetical protein  31.27 
 
 
306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00278162  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3586  putative transporter  31 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000241  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3563  putative transporter  31.67 
 
 
321 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3599  putative transporter  31.67 
 
 
321 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0879234  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3494  putative transporter  31.67 
 
 
321 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00919199  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3492  putative transporter  31.67 
 
 
321 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543428  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03049  conserved inner membrane protein  30.87 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00601022  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.87 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000715039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3377  putative transporter  30.87 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.82024e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3669  putative transporter  30.87 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000521429  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0516  hypothetical protein  30.87 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000278585  hitchhiker  0.00919443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3480  putative transporter  30.87 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000496501  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03000  hypothetical protein  30.87 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00567967  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4506  putative transporter  30.54 
 
 
321 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000436684  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  26.47 
 
 
303 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  24.44 
 
 
299 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  24.28 
 
 
299 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  24.28 
 
 
299 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  24.44 
 
 
299 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  25.82 
 
 
303 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.84 
 
 
299 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  25.82 
 
 
303 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  24.44 
 
 
299 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  26.14 
 
 
303 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  26.14 
 
 
303 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  25.82 
 
 
303 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  23.05 
 
 
315 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  24.36 
 
 
299 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  25.82 
 
 
303 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  29.79 
 
 
303 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  24.35 
 
 
299 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0416  hypothetical protein  24.11 
 
 
312 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  29.79 
 
 
303 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  28.11 
 
 
303 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  28.11 
 
 
304 aa  50.4  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  25.39 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  23.4 
 
 
299 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1984  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.94 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.825306  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2187  hypothetical protein  26.67 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0754091  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  31.19 
 
 
296 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  30.28 
 
 
296 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 
301 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  28.32 
 
 
302 aa  47  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  21.68 
 
 
305 aa  46.6  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0076  integral membrane protein  29.01 
 
 
283 aa  46.6  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  30.28 
 
 
296 aa  46.6  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2232  hypothetical protein  26.17 
 
 
295 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  22.81 
 
 
311 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4262  hypothetical protein  22.84 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5590  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.15 
 
 
314 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0480903  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.48 
 
 
325 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  25.79 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0849  hypothetical protein  26.1 
 
 
288 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  26.37 
 
 
314 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  22.98 
 
 
311 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  23.24 
 
 
304 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22 
 
 
300 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1630  O-acetylserine/cysteine export protein  23.91 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  24.35 
 
 
300 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1653  O-acetylserine/cysteine export protein  23.91 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00898793  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1818  O-acetylserine/cysteine export protein  23.91 
 
 
300 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  24.91 
 
 
297 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  23.2 
 
 
315 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  24.32 
 
 
307 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2047  hypothetical protein  24.22 
 
 
314 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  23.05 
 
 
307 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>