More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4984 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  500  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  62.23 
 
 		 302 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  60.17 
 
 		 298 aa  261  8e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  60.73 
 
 		 307 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  60.73 
 
 		 307 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  63.6 
 
 		 304 aa  252  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.67 
 
 		 300 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.67 
 
 		 313 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  58.26 
 
 		 298 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  58.67 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  58.01 
 
 		 300 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  58.01 
 
 		 300 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  56.97 
 
 		 301 aa  239  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  58.01 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  59.13 
 
 		 306 aa  238  8e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  59.5 
 
 		 299 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.73 
 
 		 300 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  59.13 
 
 		 512 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  59.13 
 
 		 343 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  59.13 
 
 		 343 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.96 
 
 		 300 aa  235  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22136  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2640  hypothetical protein  59.34 
 
 		 299 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  57.39 
 
 		 318 aa  229  4e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  58.82 
 
 		 304 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2040  hypothetical protein  59.34 
 
 		 308 aa  222  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.136673  normal  0.653396 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6312  hypothetical protein  57.58 
 
 		 300 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2873  hypothetical protein  57.14 
 
 		 300 aa  221  9e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  61.37 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3724  hypothetical protein  58.37 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3010  hypothetical protein  56.71 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0435  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.27 
 
 		 299 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.95 
 
 		 329 aa  192  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0416  hypothetical protein  40.71 
 
 		 312 aa  164  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0189  hypothetical protein  42.73 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  38.3 
 
 		 307 aa  148  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.46 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  36.03 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.65 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  27.76 
 
 		 311 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.91 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  31.56 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  32.89 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.06 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  28.51 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  28.51 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  28.09 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  29.66 
 
 		 300 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  28.81 
 
 		 289 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  28.44 
 
 		 300 aa  99  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  28.44 
 
 		 300 aa  99  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  29.27 
 
 		 307 aa  98.6  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3334  hypothetical protein  38.53 
 
 		 315 aa  92.8  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  27.85 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  31.28 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  29.78 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  27.17 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  27.17 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  29.91 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  29.91 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  32.11 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  31.08 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  29.46 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  29.41 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  28.83 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5783  hypothetical protein  32 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614473  hitchhiker  0.00280675 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  31.16 
 
 		 402 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  25.93 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.69 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  29.26 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  26.7 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  26.84 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 		 310 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.77 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  30.74 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  31.7 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  28.19 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.33 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  28.85 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  31.7 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  31.7 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.58 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  28.31 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2916  DMT family permease  30.33 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  25.44 
 
 		 303 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  31.7 
 
 		 309 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.26 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  29.53 
 
 		 301 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2851  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.66 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17163 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  28.14 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.65 
 
 		 310 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  30 
 
 		 302 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.01 
 
 		 312 aa  53.9  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.6 
 
 		 326 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  29.53 
 
 		 302 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  27.84 
 
 		 306 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  28.5 
 
 		 296 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  26.55 
 
 		 297 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  37.93 
 
 		 289 aa  52.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26.82 
 
 		 289 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>