226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2916 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2916  DMT family permease  100 
 
 		 297 aa  580  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  44.49 
 
 		 292 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  44.24 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0453  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.23 
 
 		 288 aa  192  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000315888  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  43.75 
 
 		 292 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  44.49 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  44.49 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  44.87 
 
 		 298 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  42.28 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  43.96 
 
 		 219 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  26.1 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  26.64 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.92 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  28.33 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  27.41 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  25.65 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.37 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  29.01 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  26.84 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  28.69 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  26.97 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  28.28 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  28.28 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  26.97 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  27.59 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.82 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.32 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  28.28 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  27.85 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  28.28 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  27.87 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.86 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1846  hypothetical protein  28.26 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284209 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  27.2 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  28.24 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  28.57 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  26.56 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  28.16 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4262  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.45 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  28.24 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0416  hypothetical protein  26.16 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.89 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  27.89 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  23.02 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.89 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  22.42 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  30.33 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  28.23 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  28.23 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  26.79 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  29.03 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.18 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  25.88 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  27.89 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  27.17 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  27.8 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.38 
 
 		 359 aa  54.7  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.902863 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  23.49 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.51 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4987  hypothetical protein  30.05 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.43 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.28 
 
 		 298 aa  53.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  23.51 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2981  DMT family permease  28.62 
 
 		 296 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190114  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  25.78 
 
 		 343 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  27.89 
 
 		 309 aa  53.1  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  25.78 
 
 		 343 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  25 
 
 		 317 aa  52.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  26.36 
 
 		 353 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1460  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.78 
 
 		 296 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 298 aa  52.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4038  hypothetical protein  23.05 
 
 		 287 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4527  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.71 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0952883 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  26.36 
 
 		 356 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0883  threonine and homoserine efflux system  25.38 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000921417  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0962  threonine and homoserine efflux system  25.38 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  28.08 
 
 		 402 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2830  threonine and homoserine efflux system  25.38 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  23.85 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  21.98 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  26.36 
 
 		 356 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  23.99 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  25.38 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.38 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  25.91 
 
 		 356 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0870  threonine and homoserine efflux system  25.38 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096225  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00797  hypothetical protein  25.38 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  25.38 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  28.3 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  25.91 
 
 		 356 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0439  hypothetical protein  36 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  25.91 
 
 		 356 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2507  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.42 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  25.91 
 
 		 356 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  28.9 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  27.55 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  26.46 
 
 		 512 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0837  threonine and homoserine efflux system  25.38 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0124814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2514  hypothetical protein  28.75 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292339  normal  0.385218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>