157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2514 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2514  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  528  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292339  normal  0.385218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46700  hypothetical protein  68.12 
 
 		 297 aa  348  6e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.022597  decreased coverage  0.000000235263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4022  hypothetical protein  68.12 
 
 		 297 aa  348  7e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3433  hypothetical protein  63.35 
 
 		 295 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302271  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2875  threonine and homoserine efflux system  61.76 
 
 		 293 aa  323  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00290146  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1863  hypothetical protein  63.03 
 
 		 295 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000217515  normal  0.404567 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3217  hypothetical protein  63.44 
 
 		 295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00240946  normal  0.367781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3904  hypothetical protein  61.07 
 
 		 295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544421  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2239  EamA family protein  62.63 
 
 		 295 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0001908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3499  hypothetical protein  62.63 
 
 		 295 aa  318  6e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  normal  0.669558 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1587  threonine and homoserine efflux system  61.65 
 
 		 295 aa  315  5e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00642491  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0837  threonine and homoserine efflux system  62.18 
 
 		 295 aa  315  5e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0124814  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  62.18 
 
 		 295 aa  314  9e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.18 
 
 		 295 aa  314  9e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00797  hypothetical protein  62.18 
 
 		 295 aa  314  9e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0870  threonine and homoserine efflux system  62.18 
 
 		 295 aa  314  9e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0962  threonine and homoserine efflux system  62.18 
 
 		 299 aa  314  9e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2830  threonine and homoserine efflux system  62.18 
 
 		 295 aa  314  9e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  62.18 
 
 		 295 aa  314  9e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0883  threonine and homoserine efflux system  62.18 
 
 		 295 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000921417  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1605  threonine and homoserine efflux system  63.57 
 
 		 295 aa  311  5.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140132  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1500  threonine and homoserine efflux system  63.57 
 
 		 295 aa  311  7.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.6519e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1483  threonine and homoserine efflux system  62.32 
 
 		 295 aa  310  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1768  threonine and homoserine efflux system  63.57 
 
 		 293 aa  311  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000270946  normal  0.0166943 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0870  threonine and homoserine efflux system  62.87 
 
 		 295 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0898  threonine and homoserine efflux system  62.87 
 
 		 295 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0961  threonine and homoserine efflux system  62.5 
 
 		 295 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0982  threonine and homoserine efflux system  62.5 
 
 		 295 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1300  threonine and homoserine efflux system  59.42 
 
 		 295 aa  296  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.332206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0196  hypothetical protein  59.42 
 
 		 305 aa  296  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.389436  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4855  hypothetical protein  59.36 
 
 		 285 aa  288  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2390  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.87 
 
 		 288 aa  285  5.999999999999999e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0928  threonine and homoserine efflux system  61.03 
 
 		 286 aa  282  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.09 
 
 		 293 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4814  threonine and homoserine efflux system  59.63 
 
 		 288 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.369871  normal  0.894599 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0929  hypothetical protein  59.23 
 
 		 292 aa  270  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0068  hypothetical protein  56.43 
 
 		 289 aa  259  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01032  Transporter involved in threonine and homoserine efflux  48.6 
 
 		 290 aa  252  5.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.614417  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1964  hypothetical protein  54.64 
 
 		 314 aa  249  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2617  hypothetical protein  56.63 
 
 		 289 aa  245  6e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.73 
 
 		 280 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1861  hypothetical protein  53.02 
 
 		 297 aa  241  7.999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.654734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3085  hypothetical protein  53.9 
 
 		 295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0753098  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  53.6 
 
 		 278 aa  238  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4738  hypothetical protein  52.52 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3044  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.09 
 
 		 285 aa  232  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8572  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.49 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257363  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.46 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2637  hypothetical protein  47.21 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000608588  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1197  hypothetical protein  55.68 
 
 		 295 aa  223  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2840  hypothetical protein  52.51 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316251  normal  0.316711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0094  hypothetical protein  51.72 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.73224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2766  hypothetical protein  44.73 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830467  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.72 
 
 		 291 aa  215  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615579 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0646  hypothetical protein  58.65 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.140309 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0657  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.77 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3181  hypothetical protein  49.03 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.547943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3928  hypothetical protein  53.87 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.501221  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0625  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.02 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal  0.900274 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3168  hypothetical protein  46.69 
 
 		 290 aa  192  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.302712  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2507  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.62 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5994  hypothetical protein  44 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0942193  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2958  hypothetical protein  55.25 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.395284  normal  0.675669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5800  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.53 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3425  hypothetical protein  42.22 
 
 		 292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  39.29 
 
 		 358 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2969  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.33 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0975  hypothetical protein  42.05 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000600657 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1976  hypothetical protein  44.4 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.487154 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0130  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.76 
 
 		 325 aa  145  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0233351  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.09 
 
 		 301 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2981  DMT family permease  38.75 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190114  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1460  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.69 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4527  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.36 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0952883 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4262  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.38 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1846  hypothetical protein  40.15 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2172  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.7 
 
 		 314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1994  putative integral membrane protein  39.18 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5689  hypothetical protein  31.54 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0190255  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13040  predicted permease, DMT superfamily  41.41 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0141388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3478  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.85 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.89326 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2218  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.64 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000223898  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2658  hypothetical protein  34.88 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2703  hypothetical protein  34.88 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.75974  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2688  hypothetical protein  34.88 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2395  hypothetical protein  33.73 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000810917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2072  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.71 
 
 		 327 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02390  predicted permease, DMT superfamily  39.27 
 
 		 294 aa  106  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.857756  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1520  hypothetical protein  33.47 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.965674  normal  0.0966984 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2007  hypothetical protein  33.47 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.965674  normal  0.319686 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7811  hypothetical protein  32.57 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1557  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.81 
 
 		 319 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4267  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.01 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0357814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3392  hypothetical protein  34.96 
 
 		 277 aa  99  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529802  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2563  hypothetical protein  35.77 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2608  hypothetical protein  35.77 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2602  hypothetical protein  35.77 
 
 		 277 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3333  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.11 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01360  predicted permease, DMT superfamily  30.04 
 
 		 301 aa  93.2  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.554543  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>