163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1162 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
359 aa  728    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.902863 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 
379 aa  122  9e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.6072  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  26.23 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  25.25 
 
 
292 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  23.68 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  21.6 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0453  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.54 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000315888  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  24.15 
 
 
287 aa  67  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  28.63 
 
 
301 aa  65.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  25 
 
 
317 aa  65.1  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  28.1 
 
 
292 aa  63.5  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.64 
 
 
296 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  26.42 
 
 
292 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2687  hypothetical protein  30.52 
 
 
295 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.42391  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  26.79 
 
 
292 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  21.73 
 
 
298 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  21.41 
 
 
298 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  24.29 
 
 
219 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.87 
 
 
278 aa  56.6  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  22.33 
 
 
294 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  23.55 
 
 
307 aa  56.2  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  26.74 
 
 
299 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2209  hypothetical protein  24.29 
 
 
276 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0133362  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0610  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.14 
 
 
313 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.371435  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  22.83 
 
 
298 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2109  hypothetical protein  22.96 
 
 
295 aa  54.3  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  26.55 
 
 
292 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.65 
 
 
300 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  26.6 
 
 
308 aa  53.5  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 
307 aa  53.5  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  26.56 
 
 
296 aa  53.1  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  22.03 
 
 
302 aa  53.1  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  27.88 
 
 
292 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1083  integral membrane domain-containing protein  23.43 
 
 
290 aa  52.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  0.417186 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  24.16 
 
 
324 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0816  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.25 
 
 
259 aa  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  26.01 
 
 
292 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  22.75 
 
 
293 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  23.27 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  25.23 
 
 
312 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0320  hypothetical protein  23.01 
 
 
310 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2916  DMT family permease  23.42 
 
 
297 aa  51.6  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  26.51 
 
 
296 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1225  hypothetical protein  25 
 
 
274 aa  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000294223  normal  0.640031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  25.66 
 
 
292 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.14 
 
 
293 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.815288  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  23.55 
 
 
300 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3386  hypothetical protein  25.17 
 
 
295 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.6 
 
 
309 aa  50.4  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  25.56 
 
 
311 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.57 
 
 
299 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  21.69 
 
 
292 aa  50.1  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  27.27 
 
 
292 aa  50.1  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  21.38 
 
 
296 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  23.47 
 
 
295 aa  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  21.45 
 
 
297 aa  49.7  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.52 
 
 
317 aa  50.1  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  24.43 
 
 
303 aa  49.7  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  23.1 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  22.59 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2410  hypothetical protein  27.67 
 
 
290 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116098  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  23.31 
 
 
293 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  23.13 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.5 
 
 
307 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  25.11 
 
 
269 aa  48.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  26.07 
 
 
291 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.73 
 
 
329 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  24.92 
 
 
281 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.51 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.88 
 
 
311 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  21.53 
 
 
301 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.82 
 
 
367 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  25.63 
 
 
296 aa  47.8  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  23.62 
 
 
331 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.74 
 
 
322 aa  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0408  integral membrane protein  25.99 
 
 
289 aa  47  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00379615  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  24.27 
 
 
294 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  24.27 
 
 
294 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  22.48 
 
 
313 aa  46.6  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.63 
 
 
302 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  24.27 
 
 
294 aa  46.6  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.18 
 
 
325 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.9 
 
 
311 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1060  hypothetical protein  30.7 
 
 
301 aa  46.6  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.07 
 
 
305 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  22.22 
 
 
293 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.73 
 
 
277 aa  46.2  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  22.87 
 
 
295 aa  46.2  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  21.78 
 
 
308 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.53 
 
 
305 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  23.23 
 
 
318 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  25.3 
 
 
295 aa  46.2  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1889  putative transmembrane protein  23.31 
 
 
288 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  23.14 
 
 
289 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0416  hypothetical protein  22.8 
 
 
345 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.848373  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.22 
 
 
290 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  23.23 
 
 
318 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0861  hypothetical protein  22.48 
 
 
294 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 
293 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.92 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>